More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0420 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0420  inner-membrane translocator  100 
 
 		 288 aa  543  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0077  branched-chain amino acid ABC transporter permease protein  57.44 
 
 		 298 aa  271  7e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3913  inner-membrane translocator  59.59 
 
 		 292 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.188652  normal  0.0711399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0041  inner-membrane translocator  56.08 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00123525  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7909  inner-membrane translocator  60.46 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  41.03 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1795  branched-chain amino acid ABC transporter permease  41.03 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1935  branched chain amino acid ABC transporter permease  41.03 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1970  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.03 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000947675 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  40.69 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  40.96 
 
 		 290 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2062  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.813813  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2554  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639448  normal  0.862916 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  42.14 
 
 		 652 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  39.78 
 
 		 290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3802  inner-membrane translocator  43.77 
 
 		 315 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2421  inner-membrane translocator  37.88 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719223  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1804  inner-membrane translocator  41.52 
 
 		 286 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391263  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2013  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.38 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1934  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.69 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  38.23 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3408  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.69 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000427982 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2034  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.55 
 
 		 284 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.191012  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 286 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  38.98 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7685  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.92 
 
 		 336 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350264  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  38.98 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  37.19 
 
 		 288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  35.81 
 
 		 336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2176  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 340 aa  162  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.817413  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  39.52 
 
 		 293 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0328  inner-membrane translocator  39.25 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.59084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  38.67 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1983  inner-membrane translocator  41.42 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  39.12 
 
 		 315 aa  159  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  38.14 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4885  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 341 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  38.23 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  37.16 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4207  inner-membrane translocator  36.95 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  40.34 
 
 		 285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.49 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3088  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 288 aa  152  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  40.48 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.55 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  38.65 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  38.62 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.61 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  43.64 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 524 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 524 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1753  inner-membrane translocator  38.35 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2529  inner-membrane translocator  38.02 
 
 		 345 aa  146  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.658317  normal  0.422906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.29 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 286 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3674  putative urea/short-chain amide transport system permease protein  36.8 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3799  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  34.4 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  40.83 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 526 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  38.3 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 628 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  39.79 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2329  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21186  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2337  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240816  normal  0.250903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  38.52 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1673  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.38 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  38.52 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2290  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1085  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.51 
 
 		 528 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  31.25 
 
 		 542 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2595  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0194  inner-membrane translocator  40.21 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  38.64 
 
 		 628 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 287 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 287 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1587  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 288 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8565  inner-membrane translocator  38.93 
 
 		 289 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0330607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  37.02 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6329  inner-membrane translocator  39.33 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1253  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  36.62 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>