More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7909 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7909  inner-membrane translocator  100 
 
 		 291 aa  547  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0077  branched-chain amino acid ABC transporter permease protein  66.67 
 
 		 298 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0041  inner-membrane translocator  65.68 
 
 		 299 aa  293  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00123525  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0420  inner-membrane translocator  61.43 
 
 		 288 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3913  inner-membrane translocator  60.97 
 
 		 292 aa  269  5e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.188652  normal  0.0711399 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3802  inner-membrane translocator  43.23 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  40.47 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2554  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 330 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639448  normal  0.862916 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1795  branched-chain amino acid ABC transporter permease  40.86 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1935  branched chain amino acid ABC transporter permease  40.86 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1970  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.86 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000947675 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  40.47 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  42.65 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  40 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2062  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.813813  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  39.15 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2421  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 327 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719223  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  41.5 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  40.32 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  41.34 
 
 		 652 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.59 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0328  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 327 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.59084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  42.52 
 
 		 305 aa  149  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1983  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 341 aa  148  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  36.82 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1804  inner-membrane translocator  40.86 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  36.78 
 
 		 336 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  43.82 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1934  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.47 
 
 		 286 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2013  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.47 
 
 		 286 aa  145  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7685  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.19 
 
 		 336 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350264  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  36.92 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 524 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1085  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.59 
 
 		 528 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.52 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  38 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3408  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.47 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000427982 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  40.08 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 524 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2034  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.55 
 
 		 284 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.191012  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  36.6 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4885  inner-membrane translocator  36.98 
 
 		 341 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  37.6 
 
 		 287 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  39.56 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2176  inner-membrane translocator  36.83 
 
 		 340 aa  142  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.817413  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8565  inner-membrane translocator  41.28 
 
 		 289 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0330607  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  37.22 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  37.75 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4207  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  40 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  38.3 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  36.82 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  39.06 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2529  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 345 aa  139  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.658317  normal  0.422906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1753  inner-membrane translocator  42.74 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  40.94 
 
 		 305 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4077  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 		 293 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  38.82 
 
 		 306 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  39.17 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  38.52 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  42.61 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  45.31 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  34.84 
 
 		 527 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  39.21 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  34.12 
 
 		 526 aa  136  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  37.96 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1822  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.564217  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.5 
 
 		 290 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  41.04 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.92 
 
 		 292 aa  135  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  38.76 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  39.92 
 
 		 628 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4558  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.815893  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1587  inner-membrane translocator  35.36 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3799  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  43.54 
 
 		 637 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4216  inner-membrane translocator  44.5 
 
 		 630 aa  132  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  35.36 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4011  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.68 
 
 		 515 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.430688  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  39.11 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  42.61 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2204  inner-membrane translocator  32.07 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1580  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3499  inner-membrane translocator  35.32 
 
 		 526 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  42.61 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0146  inner-membrane translocator  37.65 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000678204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  43.15 
 
 		 286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  37.65 
 
 		 315 aa  129  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  32.51 
 
 		 542 aa  129  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1371  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 336 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  43.28 
 
 		 628 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4909  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>