More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4216 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  79.75 
 
 		 637 aa  944    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  72.2 
 
 		 628 aa  825    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4216  inner-membrane translocator  100 
 
 		 630 aa  1202    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  58.06 
 
 		 633 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  56.21 
 
 		 642 aa  619  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  56.41 
 
 		 646 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  56.3 
 
 		 646 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  55.73 
 
 		 628 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4063  inner-membrane translocator  55.93 
 
 		 632 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141363  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0155  inner-membrane translocator  54.57 
 
 		 655 aa  553  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0173  inner-membrane translocator  55.11 
 
 		 635 aa  548  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0422307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1977  inner-membrane translocator  56.74 
 
 		 626 aa  538  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0859  inner-membrane translocator  55.98 
 
 		 629 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0584  inner-membrane translocator  55.67 
 
 		 613 aa  488  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.625482  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1616  inner-membrane translocator  45.87 
 
 		 622 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0311969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3084  inner-membrane translocator  45.16 
 
 		 623 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00985997  normal  0.0142053 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 652 aa  288  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.94 
 
 		 656 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  47.4 
 
 		 286 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6488  inner-membrane translocator  45.21 
 
 		 292 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115929  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 289 aa  187  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  39.65 
 
 		 287 aa  187  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  40.34 
 
 		 285 aa  186  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  40.57 
 
 		 286 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  39.65 
 
 		 293 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  41.73 
 
 		 297 aa  182  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  42.36 
 
 		 286 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  39.79 
 
 		 289 aa  177  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 286 aa  177  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  39.1 
 
 		 308 aa  176  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 293 aa  174  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 287 aa  174  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  38.14 
 
 		 315 aa  174  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  40.97 
 
 		 286 aa  174  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  42.36 
 
 		 286 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  42.36 
 
 		 286 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.89 
 
 		 290 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  39.3 
 
 		 287 aa  172  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  40.21 
 
 		 313 aa  171  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4271  inner-membrane translocator  42.25 
 
 		 314 aa  170  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  40.54 
 
 		 305 aa  170  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  31.11 
 
 		 603 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 306 aa  170  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  38.95 
 
 		 287 aa  170  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  41.05 
 
 		 290 aa  169  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  41.5 
 
 		 293 aa  169  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  40.96 
 
 		 286 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  40.28 
 
 		 299 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 283 aa  167  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3426  inner-membrane translocator  43.46 
 
 		 300 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  39.72 
 
 		 285 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.21 
 
 		 603 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  40.69 
 
 		 304 aa  165  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3321  inner-membrane translocator  40.49 
 
 		 293 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 288 aa  164  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6329  inner-membrane translocator  39.1 
 
 		 289 aa  163  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.37 
 
 		 295 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 603 aa  162  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.37 
 
 		 295 aa  162  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.13 
 
 		 286 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  41.92 
 
 		 288 aa  161  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1804  inner-membrane translocator  41.5 
 
 		 293 aa  161  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3757  putative branched-chain amino acid transport permease  37.41 
 
 		 295 aa  161  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 320 aa  160  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 603 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 306 aa  160  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  30.15 
 
 		 603 aa  160  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  40.89 
 
 		 288 aa  160  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  39.52 
 
 		 290 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 290 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0758  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 284 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.879791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 305 aa  157  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 290 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  37.83 
 
 		 320 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.06 
 
 		 294 aa  156  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  40 
 
 		 286 aa  156  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3725  inner-membrane translocator  40.28 
 
 		 294 aa  156  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0553822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0086  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 294 aa  156  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  37.22 
 
 		 315 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4487  inner-membrane translocator  38.81 
 
 		 306 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  37.32 
 
 		 282 aa  155  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 306 aa  155  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1013  inner-membrane translocator  36.95 
 
 		 298 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.361525  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 320 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2459  inner-membrane translocator  38.96 
 
 		 308 aa  155  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3519  inner-membrane translocator  37.12 
 
 		 301 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2031  inner-membrane translocator  41.36 
 
 		 300 aa  154  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 294 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 320 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 286 aa  154  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  38.79 
 
 		 291 aa  154  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  38.79 
 
 		 291 aa  154  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1453  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0626411  hitchhiker  0.000392486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3243  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 295 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.577561  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0088  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 294 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 333 aa  152  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1714  inner-membrane translocator  40.62 
 
 		 295 aa  152  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0374994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0077  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 294 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>