More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0859 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0859  inner-membrane translocator  100 
 
 		 629 aa  1193    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0155  inner-membrane translocator  75.28 
 
 		 655 aa  755    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0173  inner-membrane translocator  75.12 
 
 		 635 aa  754    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0422307  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  67.52 
 
 		 633 aa  758    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4063  inner-membrane translocator  79.32 
 
 		 632 aa  823    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141363  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  77.74 
 
 		 642 aa  884    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  69.26 
 
 		 646 aa  743    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  68.56 
 
 		 646 aa  737    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4216  inner-membrane translocator  55.5 
 
 		 630 aa  586  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  53.39 
 
 		 637 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  53.01 
 
 		 628 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  55.68 
 
 		 628 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1977  inner-membrane translocator  56 
 
 		 626 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0584  inner-membrane translocator  56.61 
 
 		 613 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.625482  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1616  inner-membrane translocator  46.3 
 
 		 622 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0311969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3084  inner-membrane translocator  44.81 
 
 		 623 aa  369  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00985997  normal  0.0142053 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 652 aa  305  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.91 
 
 		 656 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  40.61 
 
 		 286 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  41.55 
 
 		 320 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  42.05 
 
 		 286 aa  178  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  40 
 
 		 297 aa  176  9e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.54 
 
 		 603 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6488  inner-membrane translocator  44.48 
 
 		 292 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115929  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  42.11 
 
 		 320 aa  174  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  41.36 
 
 		 286 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 603 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 603 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 603 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  39.66 
 
 		 330 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 358 aa  171  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  39.14 
 
 		 306 aa  170  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.89 
 
 		 315 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 285 aa  168  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 603 aa  167  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  41.41 
 
 		 299 aa  166  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  39.08 
 
 		 289 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  41.36 
 
 		 286 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  41.36 
 
 		 286 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.13 
 
 		 290 aa  163  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  44.49 
 
 		 306 aa  162  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  41.47 
 
 		 286 aa  159  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  39.34 
 
 		 342 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  41.12 
 
 		 306 aa  158  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 308 aa  157  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  38.31 
 
 		 285 aa  156  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 346 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  39.27 
 
 		 290 aa  155  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 315 aa  155  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  41.39 
 
 		 305 aa  154  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 318 aa  154  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4271  inner-membrane translocator  40 
 
 		 314 aa  154  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 287 aa  152  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  35.74 
 
 		 315 aa  151  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3426  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 300 aa  151  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 286 aa  151  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  39.6 
 
 		 286 aa  150  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 333 aa  150  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1494  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 330 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1861  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 323 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221374 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 327 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  36.63 
 
 		 287 aa  147  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  34.05 
 
 		 368 aa  147  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 295 aa  146  9e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 305 aa  146  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4999  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 333 aa  147  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0649125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 295 aa  146  9e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 314 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 305 aa  146  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1453  inner-membrane translocator  38.29 
 
 		 330 aa  146  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0626411  hitchhiker  0.000392486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  37.21 
 
 		 293 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0758  inner-membrane translocator  42.42 
 
 		 284 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.879791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 340 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 293 aa  145  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0096  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.28 
 
 		 607 aa  145  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26664 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 287 aa  144  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  41.67 
 
 		 304 aa  144  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0852  inner-membrane translocator  37.22 
 
 		 288 aa  144  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147102  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2933  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 317 aa  144  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0799097  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  38.83 
 
 		 336 aa  144  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4565  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 315 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1573  inner-membrane translocator  33.75 
 
 		 315 aa  144  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 287 aa  144  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 286 aa  143  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  39.19 
 
 		 337 aa  143  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  39.19 
 
 		 337 aa  143  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 314 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  33.83 
 
 		 838 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3321  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 293 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  37.19 
 
 		 306 aa  143  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1579  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.687848 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0176  inner-membrane translocator  39.81 
 
 		 306 aa  142  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  34.84 
 
 		 593 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2390  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 315 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0318684  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 286 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 339 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4026  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 295 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  43.48 
 
 		 306 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1804  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 293 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3168  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 317 aa  141  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.256759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>