More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2558 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  100 
 
 		 330 aa  632  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  40.38 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  39.81 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4999  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0649125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  39.58 
 
 		 838 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  37.91 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  39.38 
 
 		 642 aa  165  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  39.25 
 
 		 333 aa  165  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4063  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 632 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141363  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  38.69 
 
 		 340 aa  164  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  40.82 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  38.67 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  36.91 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  40.69 
 
 		 314 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  37.31 
 
 		 334 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  41.22 
 
 		 311 aa  159  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 323 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.21 
 
 		 315 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  38.29 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 324 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.31 
 
 		 646 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  36.75 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 342 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  35.58 
 
 		 342 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  37.91 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 646 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  32.67 
 
 		 842 aa  153  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  36.16 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  39.33 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  35.96 
 
 		 628 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3779  inner-membrane translocator  39.29 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  34.05 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.5 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  37.36 
 
 		 344 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 633 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  35.57 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  37.95 
 
 		 332 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  35.11 
 
 		 328 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.88 
 
 		 331 aa  149  9e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 637 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1379  inner-membrane translocator  39.12 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.93 
 
 		 656 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0859  inner-membrane translocator  39.1 
 
 		 629 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  39.33 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1402  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 402 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.744825 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 338 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  36.25 
 
 		 840 aa  145  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 329 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3045  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.926794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  33.96 
 
 		 594 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1977  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 626 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0059  inner-membrane translocator  37.55 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0244383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1513  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 399 aa  143  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  37.71 
 
 		 333 aa  142  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 339 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 351 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  33.77 
 
 		 597 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1946  inner-membrane translocator  35.11 
 
 		 411 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  37.45 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  35.12 
 
 		 852 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  38.65 
 
 		 628 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2761  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 411 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1383  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1285  inner-membrane translocator  37.62 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3269  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.19 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  34.75 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  37.68 
 
 		 339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 652 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8053  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4452  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0087  inner-membrane translocator  39.78 
 
 		 324 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1175  inner-membrane translocator  38.35 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  32.19 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4399  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0105  inner-membrane translocator  38.29 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2968  inner-membrane translocator  38.29 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0087  inner-membrane translocator  38.29 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410791  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  34.04 
 
 		 332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4270  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 325 aa  135  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5097  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 330 aa  135  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282354  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 330 aa  135  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>