More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3556 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  100 
 
 		 340 aa  659    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  92.33 
 
 		 337 aa  567  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  92.33 
 
 		 337 aa  567  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  86.65 
 
 		 339 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  82.55 
 
 		 337 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  61.33 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  58.39 
 
 		 342 aa  350  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  47.9 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  43.49 
 
 		 339 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  43.49 
 
 		 339 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  42.18 
 
 		 340 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  46.55 
 
 		 344 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  44.12 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  43.85 
 
 		 314 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  49.64 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  42.66 
 
 		 342 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  42.14 
 
 		 328 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  46.85 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  41.67 
 
 		 343 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  43.62 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  41.43 
 
 		 351 aa  205  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3045  inner-membrane translocator  45.06 
 
 		 323 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.926794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  47.55 
 
 		 311 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  43.25 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  50 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  43.69 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  43.69 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  41.14 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  43.71 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.56 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  46.94 
 
 		 339 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  43.46 
 
 		 318 aa  199  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  43.73 
 
 		 323 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  43.09 
 
 		 323 aa  198  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  43.75 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3779  inner-membrane translocator  45.13 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.63 
 
 		 656 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  43.15 
 
 		 355 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  40.06 
 
 		 323 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  40.25 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  39.76 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  39.45 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  43.15 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3269  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  44.01 
 
 		 324 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1398  inner-membrane translocator  40.44 
 
 		 329 aa  193  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1285  inner-membrane translocator  43.83 
 
 		 326 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6573  inner-membrane translocator  44.7 
 
 		 347 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176253  normal  0.0417549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  42.18 
 
 		 333 aa  192  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3518  inner-membrane translocator  44.48 
 
 		 332 aa  192  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.507962 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5726  inner-membrane translocator  44.37 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6090  inner-membrane translocator  44.37 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4062  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  43.04 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  45.97 
 
 		 337 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  43.9 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2997  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  43.04 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0196  putative branched-chain amino acid ABC transporter integral membrane subunit  43.04 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.47626  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1605  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  43.04 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3327  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.04 
 
 		 324 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3988  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  43.04 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3373  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  43.04 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  42.48 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  46.24 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  45.88 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  41.84 
 
 		 838 aa  186  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1379  inner-membrane translocator  43.01 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  41.39 
 
 		 332 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  41.59 
 
 		 346 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  41.37 
 
 		 330 aa  185  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  39.94 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  40 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.2 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  40.39 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  40 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1713  inner-membrane translocator  40.97 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0542902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3117  inner-membrane translocator  41.99 
 
 		 333 aa  182  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.433038  normal  0.848648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  42.18 
 
 		 328 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  41.11 
 
 		 315 aa  182  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2463  inner-membrane translocator  42.07 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3210  inner-membrane translocator  41.67 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.756428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  38.21 
 
 		 632 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4752  inner-membrane translocator  43.48 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3516  inner-membrane translocator  41.98 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0105  inner-membrane translocator  44.68 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0087  inner-membrane translocator  44.05 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  41.25 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2968  inner-membrane translocator  44.68 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0087  inner-membrane translocator  44.68 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410791  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4270  inner-membrane translocator  42.09 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5819  inner-membrane translocator  41.52 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186482  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6725  inner-membrane translocator  41.52 
 
 		 329 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1175  inner-membrane translocator  42.55 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  38.18 
 
 		 842 aa  176  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  42.12 
 
 		 621 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3460  inner-membrane translocator  41.98 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  38.1 
 
 		 852 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  41.41 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0059  inner-membrane translocator  42.4 
 
 		 328 aa  172  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0244383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>