More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2304 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  100 
 
 		 329 aa  642    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0195  inner-membrane translocator  54.75 
 
 		 337 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.25 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  37.16 
 
 		 594 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  39.39 
 
 		 320 aa  186  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4399  inner-membrane translocator  40.99 
 
 		 333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  38.03 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4209  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 346 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0640071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0634  inner-membrane translocator  40 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0988  inner-membrane translocator  41.76 
 
 		 349 aa  176  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000237918 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0792  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 335 aa  175  9e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.756221 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  42.36 
 
 		 322 aa  175  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  36.7 
 
 		 597 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4608  inner-membrane translocator  41.54 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 339 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 339 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  38.85 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  40 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 652 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  38.27 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  38.52 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2458  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 318 aa  164  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  36.64 
 
 		 852 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  38.03 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  36.23 
 
 		 322 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  36.07 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  35.51 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  35.78 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4000  inner-membrane translocator  39.18 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  40.91 
 
 		 368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5129  inner-membrane translocator  42.25 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0107834 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 313 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3087  inner-membrane translocator  40.41 
 
 		 321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.878842  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0177  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3407  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.23 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000473911 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5097  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 330 aa  152  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282354  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  34.02 
 
 		 346 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  37.28 
 
 		 313 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4999  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0649125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  32.74 
 
 		 346 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  33.88 
 
 		 838 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  36.65 
 
 		 337 aa  149  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 361 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  36.48 
 
 		 335 aa  149  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1210  inner-membrane translocator  40.64 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  35.02 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.19 
 
 		 331 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  34.43 
 
 		 343 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 340 aa  146  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1935  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.12 
 
 		 333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 328 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4486  inner-membrane translocator  41.46 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  33.22 
 
 		 632 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  38.17 
 
 		 334 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 318 aa  142  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  35.66 
 
 		 332 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 333 aa  142  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  36.94 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  36.94 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0860  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.18038  normal  0.215748 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3210  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.756428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  30.09 
 
 		 621 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  34.14 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  34.14 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1228  inner-membrane translocator  38.67 
 
 		 354 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0580355  normal  0.0656558 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3828  inner-membrane translocator  39.84 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2014  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.383431  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.96 
 
 		 656 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2035  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.226919  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3641  inner-membrane translocator  41.1 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  36.57 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0085  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3172  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 336 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0411504  normal  0.957226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0059  inner-membrane translocator  34.96 
 
 		 328 aa  136  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0244383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  33.85 
 
 		 840 aa  136  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 330 aa  136  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1713  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 332 aa  135  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0542902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 324 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0366  inner-membrane translocator  31.31 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000392686  unclonable  0.0000000558621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2761  inner-membrane translocator  29.92 
 
 		 411 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1676  inner-membrane translocator  35.52 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>