More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A1935 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005957  BT9727_1770  branched chain amino acid ABC transporter, permease  98.2 
 
 
333 aa  648    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1935  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 
333 aa  658    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2014  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  97.9 
 
 
333 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.383431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2035  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  97.6 
 
 
333 aa  598  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.226919  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1796  branched-chain amino acid ABC transporter permease  97.6 
 
 
333 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137284  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1753  branched chain amino acid ABC transporter, permease  97.6 
 
 
333 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.20801  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1936  branched chain amino acid ABC transporter permease  97.6 
 
 
333 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1971  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  97.9 
 
 
333 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000553535 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3407  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  94.63 
 
 
298 aa  560  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000473911 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1805  inner-membrane translocator  93.99 
 
 
333 aa  550  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2422  inner-membrane translocator  35.62 
 
 
355 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3800  inner-membrane translocator  35.74 
 
 
343 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0326  inner-membrane translocator  32.68 
 
 
359 aa  172  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660469  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4060  inner-membrane translocator  37.96 
 
 
355 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0299219  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 
331 aa  169  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2061  inner-membrane translocator  33.71 
 
 
355 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427739  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2555  inner-membrane translocator  35.6 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0880453  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1982  inner-membrane translocator  35.82 
 
 
358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7686  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.35 
 
 
356 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361538  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  34.98 
 
 
330 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  32.46 
 
 
358 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  35.62 
 
 
339 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  34.04 
 
 
332 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  35.62 
 
 
339 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  34.84 
 
 
309 aa  158  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
330 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1370  inner-membrane translocator  36.25 
 
 
358 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  34.29 
 
 
361 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  33.68 
 
 
332 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4208  inner-membrane translocator  36.73 
 
 
355 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  29.84 
 
 
324 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  33.68 
 
 
332 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  30.41 
 
 
340 aa  152  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  32.34 
 
 
329 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  30.94 
 
 
344 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  33.68 
 
 
337 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  35.84 
 
 
322 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1398  inner-membrane translocator  35.34 
 
 
329 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  35.69 
 
 
323 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6725  inner-membrane translocator  33.92 
 
 
329 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  35.61 
 
 
338 aa  149  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.19 
 
 
315 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  32.07 
 
 
594 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  33.56 
 
 
320 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  32 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  31.96 
 
 
323 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4886  inner-membrane translocator  34.88 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  35.11 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5819  inner-membrane translocator  33.57 
 
 
329 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186482  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  35.62 
 
 
339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4108  inner-membrane translocator  34.83 
 
 
361 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  32.08 
 
 
340 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1713  inner-membrane translocator  36.04 
 
 
332 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0542902  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  32.06 
 
 
652 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  31.62 
 
 
333 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  34.75 
 
 
324 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  31.33 
 
 
342 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  29.52 
 
 
328 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  32.3 
 
 
368 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  31.4 
 
 
334 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  31.9 
 
 
327 aa  142  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  32.12 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  33.79 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1046  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0943  inner-membrane translocator  32.17 
 
 
351 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  30.07 
 
 
314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4270  inner-membrane translocator  32.14 
 
 
325 aa  139  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  31.53 
 
 
333 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  30.45 
 
 
332 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  33.67 
 
 
337 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
323 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  32.29 
 
 
632 aa  137  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  34.15 
 
 
320 aa  136  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  30.86 
 
 
340 aa  136  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  31.23 
 
 
346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4399  inner-membrane translocator  32.94 
 
 
333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  32.53 
 
 
335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0195  inner-membrane translocator  35.43 
 
 
337 aa  135  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  32.88 
 
 
323 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  32.62 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  31.58 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.19 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  29.56 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3516  inner-membrane translocator  30.43 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  32.34 
 
 
597 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  31.86 
 
 
322 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  31.47 
 
 
306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  31.1 
 
 
315 aa  133  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.47 
 
 
656 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
311 aa  133  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  32.76 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3045  inner-membrane translocator  32.7 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.926794  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  32.85 
 
 
319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  31.5 
 
 
334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6071  ABC transporter related  27.56 
 
 
615 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.461067  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  29.22 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  34.09 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  31.36 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  29.66 
 
 
852 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  31.02 
 
 
838 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>