More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1982 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1982  inner-membrane translocator  100 
 
 		 358 aa  696    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2422  inner-membrane translocator  70.29 
 
 		 355 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2555  inner-membrane translocator  72.99 
 
 		 355 aa  444  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0880453  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0326  inner-membrane translocator  66.57 
 
 		 359 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2061  inner-membrane translocator  70.23 
 
 		 355 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427739  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4060  inner-membrane translocator  64.97 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0299219  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7686  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  64.59 
 
 		 356 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361538  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1370  inner-membrane translocator  63.74 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4208  inner-membrane translocator  64.41 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4886  inner-membrane translocator  63.84 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3407  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.94 
 
 		 298 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000473911 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1935  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.82 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2035  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.1 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.226919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2014  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.38 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.383431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1805  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1796  branched-chain amino acid ABC transporter permease  35.4 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137284  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1936  branched chain amino acid ABC transporter permease  35.4 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1770  branched chain amino acid ABC transporter, permease  35.1 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1753  branched chain amino acid ABC transporter, permease  34.81 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.20801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1971  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.1 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000553535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 652 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 334 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  34.54 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 323 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  32.06 
 
 		 322 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3800  inner-membrane translocator  36.53 
 
 		 343 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3045  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 323 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.926794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 304 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 344 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  32.34 
 
 		 632 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 342 aa  135  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  32.85 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.81 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 337 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 337 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  33.1 
 
 		 625 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  32.22 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.58 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  29.85 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0224  inner-membrane translocator  32.82 
 
 		 441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 368 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3518  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 332 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.507962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  31.89 
 
 		 340 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4399  inner-membrane translocator  35.52 
 
 		 333 aa  129  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  30.15 
 
 		 328 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 333 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.89 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  33.87 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  36.8 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3779  inner-membrane translocator  34.12 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  32.8 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 318 aa  126  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 337 aa  126  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 346 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  32.7 
 
 		 332 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3327  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.31 
 
 		 324 aa  126  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  32.8 
 
 		 332 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  33.84 
 
 		 320 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  31.37 
 
 		 838 aa  125  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  33.75 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  34.87 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  31.59 
 
 		 678 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  32.44 
 
 		 594 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  31.6 
 
 		 852 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  32.5 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  31.63 
 
 		 328 aa  124  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3269  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.33 
 
 		 324 aa  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2997  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  34.72 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0196  putative branched-chain amino acid ABC transporter integral membrane subunit  34.72 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.47626  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4062  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  34.72 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3988  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  34.72 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3373  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  34.72 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1605  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  34.72 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6725  inner-membrane translocator  31.31 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4108  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  35.85 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1905  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  33.22 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>