More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3800 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3800  inner-membrane translocator  100 
 
 		 343 aa  675    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4108  inner-membrane translocator  39.88 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3407  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000473911 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1935  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.74 
 
 		 333 aa  186  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2014  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.383431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2035  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 		 333 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.226919  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 318 aa  169  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.29 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  39.06 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  34.84 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1805  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 333 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  38.59 
 
 		 652 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  38.64 
 
 		 323 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1753  branched chain amino acid ABC transporter, permease  35.21 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.20801  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 340 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 342 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  38.13 
 
 		 334 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  38.16 
 
 		 339 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1770  branched chain amino acid ABC transporter, permease  35.14 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1796  branched-chain amino acid ABC transporter permease  34.91 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137284  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1936  branched chain amino acid ABC transporter permease  34.91 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 342 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  37.24 
 
 		 324 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  39.39 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  37.02 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  37.77 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  37.5 
 
 		 838 aa  156  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 320 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  37.04 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  31.47 
 
 		 343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  38.05 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3779  inner-membrane translocator  37.62 
 
 		 349 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3045  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.926794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0042  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 375 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0152967  normal  0.0556674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  38.89 
 
 		 840 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1285  inner-membrane translocator  39.22 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3516  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  37.75 
 
 		 318 aa  150  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  36.66 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 340 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1971  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000553535 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  36.9 
 
 		 313 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 340 aa  145  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1379  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  35.08 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  35.08 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3269  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.57 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 324 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  35.9 
 
 		 852 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  35.59 
 
 		 330 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 337 aa  142  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2422  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 355 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0326  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 359 aa  142  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  33.68 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3327  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 		 324 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  36.58 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  34.38 
 
 		 594 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4999  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0649125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2530  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 398 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.104634  normal  0.427798 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3988  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4062  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0196  putative branched-chain amino acid ABC transporter integral membrane subunit  36.16 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.47626  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1605  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  33.66 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3373  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2997  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.89 
 
 		 646 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0078  branched-chain amino acid ABC transporter permease protein  35.37 
 
 		 374 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17119  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1402  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 402 aa  139  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.744825 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1982  inner-membrane translocator  36.53 
 
 		 358 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 646 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  32.2 
 
 		 621 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.19 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2463  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 333 aa  138  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>