More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4327 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0173  inner-membrane translocator  66.77 
 
 		 635 aa  703    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0422307  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0859  inner-membrane translocator  67.59 
 
 		 629 aa  681    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  100 
 
 		 646 aa  1254    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0155  inner-membrane translocator  66.94 
 
 		 655 aa  703    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4063  inner-membrane translocator  66.94 
 
 		 632 aa  712    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141363  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  66.67 
 
 		 642 aa  773    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  86.78 
 
 		 633 aa  1012    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  97.21 
 
 		 646 aa  1121    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4216  inner-membrane translocator  57.67 
 
 		 630 aa  620  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  56.98 
 
 		 637 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  53.98 
 
 		 628 aa  567  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  52.98 
 
 		 628 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1977  inner-membrane translocator  53.05 
 
 		 626 aa  498  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0584  inner-membrane translocator  50.41 
 
 		 613 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.625482  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3084  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 623 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00985997  normal  0.0142053 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1616  inner-membrane translocator  44.17 
 
 		 622 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0311969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 652 aa  296  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.89 
 
 		 656 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6488  inner-membrane translocator  43.89 
 
 		 292 aa  187  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115929  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 297 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  38.98 
 
 		 320 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  38.74 
 
 		 286 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  43.43 
 
 		 305 aa  170  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  39.16 
 
 		 320 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 286 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  37.09 
 
 		 342 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 306 aa  165  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  37.75 
 
 		 289 aa  165  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  41.37 
 
 		 306 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 286 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  35.57 
 
 		 285 aa  162  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 306 aa  161  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  39.4 
 
 		 286 aa  160  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 318 aa  160  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 289 aa  160  9e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.46 
 
 		 603 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 286 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 286 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 293 aa  158  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  38.59 
 
 		 304 aa  158  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 358 aa  158  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  39.4 
 
 		 299 aa  158  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  34.43 
 
 		 346 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.37 
 
 		 315 aa  157  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  31.42 
 
 		 603 aa  157  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  31.42 
 
 		 603 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  35.21 
 
 		 330 aa  156  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 328 aa  155  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 603 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 328 aa  154  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  37.71 
 
 		 306 aa  154  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 314 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 286 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 308 aa  153  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 603 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  37.95 
 
 		 305 aa  152  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4609  inner-membrane translocator  39.26 
 
 		 329 aa  151  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3426  inner-membrane translocator  39.06 
 
 		 300 aa  151  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.63 
 
 		 290 aa  151  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  39.34 
 
 		 336 aa  151  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5096  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 303 aa  150  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681438  normal  0.989251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 286 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  36.95 
 
 		 285 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  33.74 
 
 		 328 aa  149  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 287 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  38.16 
 
 		 305 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 293 aa  148  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 333 aa  148  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 287 aa  148  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 283 aa  148  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 286 aa  146  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  38.67 
 
 		 306 aa  146  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  37.87 
 
 		 315 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  34.5 
 
 		 852 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  37.04 
 
 		 337 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 286 aa  145  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4487  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 306 aa  145  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 287 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 293 aa  144  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 351 aa  144  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1013  inner-membrane translocator  35.12 
 
 		 298 aa  144  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.361525  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 287 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3321  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 293 aa  143  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0096  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.51 
 
 		 607 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 339 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2459  inner-membrane translocator  38.58 
 
 		 308 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 337 aa  142  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 337 aa  142  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 313 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 346 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 333 aa  140  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  36 
 
 		 340 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 332 aa  141  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  38.24 
 
 		 306 aa  140  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 286 aa  140  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.64 
 
 		 331 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  35.12 
 
 		 296 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  31.66 
 
 		 343 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  35.12 
 
 		 296 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4999  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 333 aa  140  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0649125  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>