More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4819 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 336 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0665  branched chain amino acid ABC transporter permease  48.17 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 286 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 290 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  40.14 
 
 		 286 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  35.84 
 
 		 287 aa  179  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  35.84 
 
 		 287 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  35.49 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 288 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  36.61 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  36.61 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 287 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 288 aa  166  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  36.61 
 
 		 290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 288 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3088  inner-membrane translocator  37.2 
 
 		 288 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 288 aa  162  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 308 aa  162  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.52 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  34.73 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 283 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  31.42 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 289 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 299 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 306 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 305 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5096  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681438  normal  0.989251 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1795  branched-chain amino acid ABC transporter permease  31.76 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  31.76 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1935  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.76 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 282 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1970  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000947675 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 305 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3674  putative urea/short-chain amide transport system permease protein  35.05 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.53 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0176  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0420  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 288 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 306 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 306 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  34.24 
 
 		 285 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0852  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 288 aa  142  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147102  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 296 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 296 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2062  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 353 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.813813  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 652 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2236  inner-membrane translocator  37.74 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 628 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2554  inner-membrane translocator  32.8 
 
 		 330 aa  139  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639448  normal  0.862916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2810  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 291 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144743  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4108  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 283 aa  139  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4487  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 306 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3408  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 		 286 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000427982 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0194  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 289 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1934  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.09 
 
 		 286 aa  135  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.44 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3184  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.819999 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  35.69 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  36.03 
 
 		 286 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2013  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 		 286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2034  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.29 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.191012  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0649  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1748  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294925  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3557  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4558  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.815893  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3476  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  32.4 
 
 		 286 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3426  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 300 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 287 aa  132  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3731  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 289 aa  132  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2024  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1804  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 286 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391263  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3802  inner-membrane translocator  33.69 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2421  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719223  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 642 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2688  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00282736  normal  0.252388 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  33.22 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1178  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1580  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0365  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4207  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7685  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.55 
 
 		 336 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350264  normal  0.53556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>