More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7685 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7685  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 336 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350264  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4885  inner-membrane translocator  85.84 
 
 		 341 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4059  inner-membrane translocator  87.5 
 
 		 336 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372426  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4207  inner-membrane translocator  85.84 
 
 		 339 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1371  inner-membrane translocator  85.12 
 
 		 336 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2062  inner-membrane translocator  60.12 
 
 		 353 aa  384  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.813813  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1983  inner-membrane translocator  65.36 
 
 		 341 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2554  inner-membrane translocator  61.26 
 
 		 330 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639448  normal  0.862916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2421  inner-membrane translocator  60.6 
 
 		 327 aa  346  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719223  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0328  inner-membrane translocator  60.4 
 
 		 327 aa  328  9e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.59084  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  40 
 
 		 286 aa  205  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  40.34 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1795  branched-chain amino acid ABC transporter permease  40.34 
 
 		 286 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1970  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.34 
 
 		 286 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000947675 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1935  branched chain amino acid ABC transporter permease  40.34 
 
 		 286 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1804  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 286 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391263  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1934  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.69 
 
 		 286 aa  176  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2034  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.66 
 
 		 284 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.191012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2013  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.66 
 
 		 286 aa  175  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3408  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.69 
 
 		 286 aa  175  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000427982 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 286 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 290 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  36.15 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 290 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  38.55 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 290 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  36.57 
 
 		 306 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 288 aa  149  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 297 aa  149  9e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  34.72 
 
 		 652 aa  146  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 287 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4487  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.27 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0420  inner-membrane translocator  36.95 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0077  branched-chain amino acid ABC transporter permease protein  37.62 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 286 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 305 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1494  inner-membrane translocator  36.02 
 
 		 330 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 291 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  37.16 
 
 		 315 aa  135  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3088  inner-membrane translocator  34.24 
 
 		 288 aa  135  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  34.21 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1453  inner-membrane translocator  36.78 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0626411  hitchhiker  0.000392486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0852  inner-membrane translocator  34.14 
 
 		 288 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  35.1 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 286 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 313 aa  132  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3913  inner-membrane translocator  39.11 
 
 		 292 aa  132  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.188652  normal  0.0711399 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 628 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  32.8 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0194  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  34.65 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0176  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 286 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0041  inner-membrane translocator  37.87 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00123525  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2176  inner-membrane translocator  35.51 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.817413  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  31.29 
 
 		 542 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1580  inner-membrane translocator  31.67 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  35.42 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4558  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.815893  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1587  inner-membrane translocator  31 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1861  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 323 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221374 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2529  inner-membrane translocator  34.09 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.658317  normal  0.422906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1944  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 642 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2696  inner-membrane translocator  33.57 
 
 		 554 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.665567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0665  branched chain amino acid ABC transporter permease  34.98 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3317  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.74 
 
 		 545 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321889  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1616  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 622 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0311969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3731  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 289 aa  123  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0300  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  31.47 
 
 		 642 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247535  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 286 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1400  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 342 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704678  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 286 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3062  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.38 
 
 		 550 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0365  inner-membrane translocator  34.64 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.29 
 
 		 523 aa  122  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619152  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4018  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 639 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2619  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.97 
 
 		 545 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.098179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>