More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1983 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1983  inner-membrane translocator  100 
 
 		 341 aa  652    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2062  inner-membrane translocator  69.47 
 
 		 353 aa  435  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.813813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7685  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  65.36 
 
 		 336 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350264  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4885  inner-membrane translocator  63.24 
 
 		 341 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2554  inner-membrane translocator  70.2 
 
 		 330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639448  normal  0.862916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4207  inner-membrane translocator  63.42 
 
 		 339 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4059  inner-membrane translocator  63.64 
 
 		 336 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372426  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1371  inner-membrane translocator  65.36 
 
 		 336 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2421  inner-membrane translocator  65.42 
 
 		 327 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719223  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0328  inner-membrane translocator  68.32 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.59084  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  40 
 
 		 286 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1795  branched-chain amino acid ABC transporter permease  40.34 
 
 		 286 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1935  branched chain amino acid ABC transporter permease  40.34 
 
 		 286 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1970  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.34 
 
 		 286 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000947675 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  40.34 
 
 		 286 aa  206  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1804  inner-membrane translocator  41.1 
 
 		 286 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391263  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 286 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2013  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.69 
 
 		 286 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2034  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.69 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.191012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1934  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.69 
 
 		 286 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3408  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.69 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000427982 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  37.95 
 
 		 297 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0420  inner-membrane translocator  41.81 
 
 		 288 aa  166  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 305 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 293 aa  159  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  35.12 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 290 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  35.82 
 
 		 290 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0077  branched-chain amino acid ABC transporter permease protein  41.86 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4487  inner-membrane translocator  35.43 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 652 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  36.58 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 306 aa  153  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  37.75 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 293 aa  149  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 287 aa  149  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3913  inner-membrane translocator  41.33 
 
 		 292 aa  149  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.188652  normal  0.0711399 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2176  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.817413  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  33.75 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  38.72 
 
 		 628 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 290 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0041  inner-membrane translocator  42.59 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00123525  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 287 aa  146  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1453  inner-membrane translocator  36.4 
 
 		 330 aa  145  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0626411  hitchhiker  0.000392486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 287 aa  145  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 288 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  36.98 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1494  inner-membrane translocator  36.4 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0176  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 306 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  35.13 
 
 		 306 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 286 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  37.75 
 
 		 304 aa  142  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 628 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 288 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  37.41 
 
 		 285 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1580  inner-membrane translocator  34 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 291 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 285 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  33.44 
 
 		 315 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  32.72 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0365  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 306 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  34.24 
 
 		 542 aa  136  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1587  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 288 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.59 
 
 		 290 aa  135  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  36.28 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4558  inner-membrane translocator  33 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.815893  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0194  inner-membrane translocator  38.68 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3802  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4216  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 630 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6329  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 289 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0852  inner-membrane translocator  32.55 
 
 		 288 aa  133  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147102  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2459  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 308 aa  132  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2529  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.658317  normal  0.422906 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3088  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 288 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1400  inner-membrane translocator  36.02 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704678  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  37.16 
 
 		 286 aa  129  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1861  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 323 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221374 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2236  inner-membrane translocator  38.24 
 
 		 306 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2390  inner-membrane translocator  39.15 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0318684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.67 
 
 		 294 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 294 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4700  inner-membrane translocator  34.7 
 
 		 296 aa  126  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.365465  normal  0.476107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>