More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2529 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2529  inner-membrane translocator  100 
 
 		 345 aa  652    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.658317  normal  0.422906 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2176  inner-membrane translocator  58.14 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.817413  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 652 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  39.1 
 
 		 289 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 304 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  38.74 
 
 		 299 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  36 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3802  inner-membrane translocator  41.22 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  34.91 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 287 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  37.66 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  37.66 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  37 
 
 		 287 aa  142  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  32.83 
 
 		 306 aa  142  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8565  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0330607  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  38.29 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  37.62 
 
 		 286 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  35.06 
 
 		 286 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 315 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3459  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 289 aa  135  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.411869  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1051  inner-membrane translocator  33.87 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1795  branched-chain amino acid ABC transporter permease  35.06 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  35.39 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1935  branched chain amino acid ABC transporter permease  35.06 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1970  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000947675 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 286 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 628 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  34.91 
 
 		 290 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.44 
 
 		 292 aa  133  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.57 
 
 		 290 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0053  inner-membrane translocator  34.57 
 
 		 291 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 285 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1753  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  36.98 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  36.16 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3557  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2062  inner-membrane translocator  34.06 
 
 		 353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.813813  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2554  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639448  normal  0.862916 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3674  putative urea/short-chain amide transport system permease protein  34.42 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 286 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 286 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0420  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 288 aa  126  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  36.47 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.67 
 
 		 296 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  34.94 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7685  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.42 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350264  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  37.54 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3088  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1804  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 293 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 		 294 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 288 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4228  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.73 
 
 		 551 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0420008  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  29.65 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2024  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5096  inner-membrane translocator  34.45 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681438  normal  0.989251 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1804  inner-membrane translocator  36.28 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  38.24 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3829  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 335 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.956576  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 290 aa  122  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.56 
 
 		 286 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2421  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719223  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.07 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  32.47 
 
 		 628 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.07 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2760  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2937  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3374  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0197  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2996  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3989  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4063  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1945  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3321  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1606  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1791  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.19 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 526 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4487  inner-membrane translocator  32.9 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1382  inner-membrane translocator  32.47 
 
 		 343 aa  119  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0563263 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 286 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>