More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1616 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3084  inner-membrane translocator  86.25 
 
 		 623 aa  950    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00985997  normal  0.0142053 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1616  inner-membrane translocator  100 
 
 		 622 aa  1189    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0311969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  45.19 
 
 		 628 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  43.7 
 
 		 637 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  45.45 
 
 		 642 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  44.35 
 
 		 628 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4216  inner-membrane translocator  45.4 
 
 		 630 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 646 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  43.63 
 
 		 646 aa  372  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  43.57 
 
 		 633 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4063  inner-membrane translocator  44.71 
 
 		 632 aa  359  7e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141363  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0155  inner-membrane translocator  46.74 
 
 		 655 aa  351  3e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0173  inner-membrane translocator  45.14 
 
 		 635 aa  345  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0422307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1977  inner-membrane translocator  44.3 
 
 		 626 aa  341  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0859  inner-membrane translocator  45.93 
 
 		 629 aa  330  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0584  inner-membrane translocator  45.63 
 
 		 613 aa  323  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.625482  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 652 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.22 
 
 		 656 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  39.4 
 
 		 297 aa  179  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  38.68 
 
 		 286 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 286 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 287 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  38.28 
 
 		 287 aa  163  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  43.77 
 
 		 286 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 287 aa  158  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  38.14 
 
 		 283 aa  156  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 290 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 287 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 305 aa  154  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 290 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6488  inner-membrane translocator  40 
 
 		 292 aa  153  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115929  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 288 aa  153  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 293 aa  152  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  36.82 
 
 		 286 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  38.14 
 
 		 313 aa  150  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 286 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 289 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 308 aa  148  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 304 aa  147  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3321  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 293 aa  146  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 291 aa  145  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 288 aa  144  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 288 aa  144  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 299 aa  144  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 293 aa  144  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  34.02 
 
 		 315 aa  144  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3294  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  36.11 
 
 		 295 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0420921  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  38.57 
 
 		 288 aa  142  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.89 
 
 		 295 aa  141  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4026  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 295 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.89 
 
 		 295 aa  141  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 290 aa  140  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7685  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.86 
 
 		 336 aa  139  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350264  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 290 aa  138  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 282 aa  138  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  34.68 
 
 		 291 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 305 aa  137  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 289 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4885  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 341 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 306 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 291 aa  134  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3967  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  34.34 
 
 		 293 aa  134  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 293 aa  133  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1714  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 295 aa  133  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0374994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3426  inner-membrane translocator  36.98 
 
 		 300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  32.75 
 
 		 286 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 286 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 290 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  34.1 
 
 		 305 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 306 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 306 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 306 aa  132  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4207  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 339 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0194  inner-membrane translocator  42.61 
 
 		 289 aa  130  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3088  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 288 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  38.04 
 
 		 318 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  38.03 
 
 		 306 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4108  inner-membrane translocator  37.02 
 
 		 283 aa  129  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3731  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 289 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  32.3 
 
 		 285 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  34.68 
 
 		 285 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3575  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 291 aa  129  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2974  putative branched-chain amino acid transport system permease protein  34.68 
 
 		 307 aa  128  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  29.84 
 
 		 603 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0852  inner-membrane translocator  35 
 
 		 288 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147102  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 286 aa  127  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2236  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 306 aa  127  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.23 
 
 		 603 aa  127  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1804  inner-membrane translocator  36.82 
 
 		 293 aa  127  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6726  inner-membrane translocator  35.77 
 
 		 295 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0649  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.28 
 
 		 289 aa  126  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.65 
 
 		 286 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1353  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 301 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3289  hypothetical protein  35.07 
 
 		 295 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0960576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5096  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 303 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681438  normal  0.989251 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5820  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 295 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  0.153687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  29.65 
 
 		 603 aa  125  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4609  inner-membrane translocator  39.26 
 
 		 329 aa  124  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2062  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 353 aa  124  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.813813  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  34.24 
 
 		 286 aa  123  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>