More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3084 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3084  inner-membrane translocator  100 
 
 		 623 aa  1185    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00985997  normal  0.0142053 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1616  inner-membrane translocator  87.19 
 
 		 622 aa  944    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0311969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  43.96 
 
 		 628 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  44.34 
 
 		 637 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  43.08 
 
 		 628 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  44.21 
 
 		 642 aa  382  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4216  inner-membrane translocator  45 
 
 		 630 aa  375  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.68 
 
 		 646 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 646 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  41.65 
 
 		 633 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0155  inner-membrane translocator  45.53 
 
 		 655 aa  351  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0173  inner-membrane translocator  44.93 
 
 		 635 aa  345  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0422307  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4063  inner-membrane translocator  43.42 
 
 		 632 aa  342  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141363  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1977  inner-membrane translocator  44.28 
 
 		 626 aa  335  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0859  inner-membrane translocator  43.77 
 
 		 629 aa  310  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0584  inner-membrane translocator  45.18 
 
 		 613 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.625482  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 652 aa  216  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.47 
 
 		 656 aa  203  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  39.59 
 
 		 297 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 286 aa  173  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 286 aa  171  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  44.59 
 
 		 286 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  38.62 
 
 		 287 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  38.97 
 
 		 287 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6488  inner-membrane translocator  40.75 
 
 		 292 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115929  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 287 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 287 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 283 aa  155  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3321  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 293 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 305 aa  147  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 290 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 286 aa  146  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  36.63 
 
 		 291 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 290 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 289 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  38.14 
 
 		 313 aa  145  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 308 aa  143  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 304 aa  141  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 299 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 286 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 282 aa  140  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 288 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.84 
 
 		 290 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 293 aa  138  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 293 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 288 aa  137  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 293 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  34.02 
 
 		 315 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  37.62 
 
 		 306 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 305 aa  135  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  34.65 
 
 		 291 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 306 aa  133  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 288 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7685  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350264  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3294  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  36.71 
 
 		 295 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0420921  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.16 
 
 		 286 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  34.36 
 
 		 285 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4026  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 295 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4885  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 341 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 289 aa  132  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  33.22 
 
 		 286 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4108  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 283 aa  132  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  37.22 
 
 		 305 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4207  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 339 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  39.26 
 
 		 318 aa  131  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3967  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 293 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  36.07 
 
 		 306 aa  130  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3575  inner-membrane translocator  36.61 
 
 		 291 aa  130  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 306 aa  130  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.79 
 
 		 295 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.79 
 
 		 295 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 290 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  33.67 
 
 		 336 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5096  inner-membrane translocator  38.94 
 
 		 303 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681438  normal  0.989251 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 285 aa  128  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 286 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 286 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3731  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 289 aa  127  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 288 aa  127  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.34 
 
 		 603 aa  127  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1353  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 301 aa  126  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2974  putative branched-chain amino acid transport system permease protein  34.93 
 
 		 307 aa  126  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1714  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 295 aa  126  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0374994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 290 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 296 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 286 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  35.49 
 
 		 286 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 296 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 291 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0649  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 		 289 aa  125  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  34.67 
 
 		 330 aa  125  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3426  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 300 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  28.76 
 
 		 603 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  33.56 
 
 		 286 aa  124  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1795  branched-chain amino acid ABC transporter permease  33.56 
 
 		 286 aa  124  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1970  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 		 286 aa  124  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000947675 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1935  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.56 
 
 		 286 aa  124  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 603 aa  123  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  31.7 
 
 		 306 aa  123  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2062  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.813813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>