More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0155 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  66.4 
 
 		 646 aa  724    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0859  inner-membrane translocator  75.28 
 
 		 629 aa  727    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0155  inner-membrane translocator  100 
 
 		 655 aa  1241    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  63.7 
 
 		 633 aa  721    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4063  inner-membrane translocator  70.57 
 
 		 632 aa  754    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141363  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0173  inner-membrane translocator  98.11 
 
 		 635 aa  1177    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0422307  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  67.15 
 
 		 646 aa  726    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  72.22 
 
 		 642 aa  824    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4216  inner-membrane translocator  55.25 
 
 		 630 aa  581  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  53.96 
 
 		 637 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  53.58 
 
 		 628 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  53.8 
 
 		 628 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1977  inner-membrane translocator  54.24 
 
 		 626 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0584  inner-membrane translocator  53.77 
 
 		 613 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.625482  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1616  inner-membrane translocator  47.78 
 
 		 622 aa  388  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0311969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3084  inner-membrane translocator  46.28 
 
 		 623 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00985997  normal  0.0142053 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 652 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.08 
 
 		 656 aa  211  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 286 aa  193  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  43.39 
 
 		 297 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6488  inner-membrane translocator  45.51 
 
 		 292 aa  187  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115929  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  43.38 
 
 		 286 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  43.54 
 
 		 286 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 320 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  43.23 
 
 		 286 aa  172  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  40.97 
 
 		 306 aa  172  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  43.2 
 
 		 286 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  43.2 
 
 		 286 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 287 aa  171  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  38.16 
 
 		 306 aa  168  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 305 aa  167  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 320 aa  166  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 285 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  41.94 
 
 		 299 aa  165  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  40.26 
 
 		 305 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  38.38 
 
 		 330 aa  163  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 289 aa  162  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1494  inner-membrane translocator  38.97 
 
 		 330 aa  162  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 287 aa  160  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 306 aa  160  9e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3321  inner-membrane translocator  40.46 
 
 		 293 aa  160  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 308 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1453  inner-membrane translocator  38.67 
 
 		 330 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0626411  hitchhiker  0.000392486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 293 aa  159  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  38.1 
 
 		 285 aa  159  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 286 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.8 
 
 		 290 aa  158  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 293 aa  158  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  30 
 
 		 603 aa  158  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  38.94 
 
 		 293 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 283 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  39.44 
 
 		 306 aa  157  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  42.07 
 
 		 315 aa  156  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.62 
 
 		 603 aa  156  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 313 aa  156  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  37.83 
 
 		 315 aa  155  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 287 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  39.07 
 
 		 288 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1579  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 315 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.687848 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 603 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1573  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 315 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4565  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 315 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 287 aa  152  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 603 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 603 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  37.71 
 
 		 289 aa  151  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  38.18 
 
 		 286 aa  151  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 290 aa  151  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  39.2 
 
 		 286 aa  151  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 290 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 288 aa  150  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4609  inner-membrane translocator  43.96 
 
 		 329 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  38.18 
 
 		 282 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0176  inner-membrane translocator  41.45 
 
 		 306 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 290 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  40.32 
 
 		 306 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1804  inner-membrane translocator  39.6 
 
 		 293 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1861  inner-membrane translocator  37.96 
 
 		 323 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1400  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 342 aa  148  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704678  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1294  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 313 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 286 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3426  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 300 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1901  inner-membrane translocator  40.66 
 
 		 311 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.214126 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.33 
 
 		 295 aa  147  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.33 
 
 		 295 aa  147  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  39.46 
 
 		 286 aa  147  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2390  inner-membrane translocator  38.34 
 
 		 315 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0318684  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1333  inner-membrane translocator  40.91 
 
 		 312 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0102274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0225  inner-membrane translocator  37.74 
 
 		 317 aa  146  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4168  inner-membrane translocator  36.48 
 
 		 315 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0932  inner-membrane translocator  41.04 
 
 		 311 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.240401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1414  inner-membrane translocator  41.04 
 
 		 311 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1353  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 301 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3168  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 317 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6329  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 289 aa  144  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1580  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 288 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0096  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.85 
 
 		 607 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26664 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  39.74 
 
 		 296 aa  144  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  39.07 
 
 		 288 aa  144  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0194  inner-membrane translocator  43.23 
 
 		 289 aa  144  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>