More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4609 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4609  inner-membrane translocator  100 
 
 		 329 aa  625  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  62.5 
 
 		 305 aa  346  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  60.81 
 
 		 306 aa  328  6e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  55.07 
 
 		 306 aa  308  5.9999999999999995e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  59.46 
 
 		 306 aa  305  7e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  58.16 
 
 		 305 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  57.44 
 
 		 304 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  58.64 
 
 		 306 aa  300  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4487  inner-membrane translocator  57.29 
 
 		 306 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  53.74 
 
 		 308 aa  292  5e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  55.07 
 
 		 305 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  55.56 
 
 		 306 aa  284  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  56.46 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2459  inner-membrane translocator  54.05 
 
 		 308 aa  272  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  56.12 
 
 		 306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5096  inner-membrane translocator  56.86 
 
 		 303 aa  268  8.999999999999999e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681438  normal  0.989251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0365  inner-membrane translocator  55.22 
 
 		 306 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2236  inner-membrane translocator  57.09 
 
 		 306 aa  258  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0861  inner-membrane translocator  57.43 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.220727  normal  0.159133 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4044  inner-membrane translocator  59.8 
 
 		 304 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4400  inner-membrane translocator  52.17 
 
 		 304 aa  255  7e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0635  inner-membrane translocator  54.24 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0733  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  58.19 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  48.82 
 
 		 287 aa  252  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0176  inner-membrane translocator  48.99 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  47.12 
 
 		 287 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  47.46 
 
 		 287 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  47.12 
 
 		 287 aa  245  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  47.14 
 
 		 288 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  49.66 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  45.36 
 
 		 293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  45.6 
 
 		 293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  48.48 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  44.04 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  46.94 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  43.69 
 
 		 290 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  43.34 
 
 		 290 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  45.58 
 
 		 286 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  45.79 
 
 		 288 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  47.28 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  45.45 
 
 		 288 aa  220  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  45.58 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  40.82 
 
 		 286 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3088  inner-membrane translocator  47.67 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.2 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 652 aa  186  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  38.94 
 
 		 297 aa  187  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  44.84 
 
 		 633 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  39.31 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  42.75 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  41.41 
 
 		 628 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  39.2 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  41.47 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  39.23 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.88 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  40.27 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0852  inner-membrane translocator  40 
 
 		 288 aa  172  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 291 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  40.94 
 
 		 642 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1795  branched-chain amino acid ABC transporter permease  39.23 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1935  branched chain amino acid ABC transporter permease  39.23 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1970  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.23 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000947675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  40.23 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  39.23 
 
 		 286 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 289 aa  169  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  39.46 
 
 		 286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  38.37 
 
 		 628 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1453  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0626411  hitchhiker  0.000392486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0225  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1494  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 330 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  37.5 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 285 aa  162  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0020  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.03 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3046  inner-membrane translocator  36.03 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  41.89 
 
 		 637 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3168  inner-membrane translocator  35.2 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  44.05 
 
 		 646 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  39.46 
 
 		 286 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6329  inner-membrane translocator  36.82 
 
 		 289 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  39.46 
 
 		 286 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  43.65 
 
 		 646 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 294 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  39.59 
 
 		 282 aa  159  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4565  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4885  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  38.46 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4216  inner-membrane translocator  40.58 
 
 		 630 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0086  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4207  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 339 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0058  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4451  inner-membrane translocator  37.04 
 
 		 295 aa  156  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8052  inner-membrane translocator  37.04 
 
 		 293 aa  156  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 320 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 320 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7685  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.18 
 
 		 336 aa  155  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350264  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0197  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.35 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>