More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4063 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  80.36 
 
 		 642 aa  932    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0155  inner-membrane translocator  70.57 
 
 		 655 aa  755    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4063  inner-membrane translocator  100 
 
 		 632 aa  1229    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141363  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  66.99 
 
 		 646 aa  747    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  64.22 
 
 		 633 aa  745    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0859  inner-membrane translocator  79.16 
 
 		 629 aa  791    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0173  inner-membrane translocator  70.89 
 
 		 635 aa  759    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0422307  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  65.71 
 
 		 646 aa  746    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  55.45 
 
 		 637 aa  621  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4216  inner-membrane translocator  55.93 
 
 		 630 aa  614  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  53.72 
 
 		 628 aa  587  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  53.06 
 
 		 628 aa  551  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1977  inner-membrane translocator  54.07 
 
 		 626 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0584  inner-membrane translocator  52.87 
 
 		 613 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.625482  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3084  inner-membrane translocator  43.73 
 
 		 623 aa  385  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00985997  normal  0.0142053 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1616  inner-membrane translocator  45.72 
 
 		 622 aa  382  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0311969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  35.32 
 
 		 652 aa  301  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.85 
 
 		 656 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  42.03 
 
 		 286 aa  192  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  39.55 
 
 		 320 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  42.37 
 
 		 297 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.98 
 
 		 603 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  43.24 
 
 		 286 aa  180  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  31.46 
 
 		 603 aa  180  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  31.3 
 
 		 603 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  31.33 
 
 		 603 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  31.3 
 
 		 603 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  39.79 
 
 		 320 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  41.61 
 
 		 289 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  41.89 
 
 		 286 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  39.94 
 
 		 308 aa  173  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.46 
 
 		 290 aa  173  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  40.33 
 
 		 306 aa  173  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6488  inner-membrane translocator  43.71 
 
 		 292 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  37.59 
 
 		 330 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 358 aa  170  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  42.03 
 
 		 299 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  41.89 
 
 		 286 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  41.89 
 
 		 286 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  37 
 
 		 285 aa  166  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  41.39 
 
 		 305 aa  166  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  39.19 
 
 		 342 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  41.28 
 
 		 286 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  34.85 
 
 		 333 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  39.09 
 
 		 306 aa  162  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0096  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.91 
 
 		 607 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  39.68 
 
 		 306 aa  160  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3321  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 293 aa  160  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.19 
 
 		 315 aa  158  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  39.67 
 
 		 305 aa  157  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.7 
 
 		 295 aa  155  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.7 
 
 		 295 aa  155  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 287 aa  154  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 314 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3425  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 344 aa  153  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 313 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  37.29 
 
 		 285 aa  153  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  40.33 
 
 		 318 aa  153  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  40.33 
 
 		 306 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 323 aa  151  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 346 aa  151  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1494  inner-membrane translocator  39.31 
 
 		 330 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 340 aa  150  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4609  inner-membrane translocator  45.33 
 
 		 329 aa  150  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4026  inner-membrane translocator  39.46 
 
 		 295 aa  150  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 296 aa  150  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 296 aa  150  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  39 
 
 		 286 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3294  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  39.46 
 
 		 295 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0420921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  32.56 
 
 		 332 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1901  inner-membrane translocator  40.19 
 
 		 311 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.214126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3426  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 300 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  40.72 
 
 		 306 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0932  inner-membrane translocator  40.51 
 
 		 311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.240401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1414  inner-membrane translocator  40.51 
 
 		 311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  33.33 
 
 		 593 aa  148  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  39.23 
 
 		 315 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  39.6 
 
 		 286 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  36.39 
 
 		 313 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0194  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 289 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1453  inner-membrane translocator  38.93 
 
 		 330 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0626411  hitchhiker  0.000392486 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  39.19 
 
 		 305 aa  147  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 304 aa  147  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1714  inner-membrane translocator  42.57 
 
 		 295 aa  147  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0374994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 287 aa  147  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1294  inner-membrane translocator  40.06 
 
 		 313 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 343 aa  146  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  33.33 
 
 		 594 aa  146  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 315 aa  146  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 317 aa  146  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  37.09 
 
 		 293 aa  146  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  35.12 
 
 		 328 aa  146  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0059  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0244383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 287 aa  146  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 328 aa  146  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1861  inner-membrane translocator  37.12 
 
 		 323 aa  146  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221374 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2653  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.79 
 
 		 311 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  36.76 
 
 		 306 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1333  inner-membrane translocator  40.06 
 
 		 312 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0102274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 287 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>