More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2583 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  100 
 
 
306 aa  585  1e-166  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  61.07 
 
 
338 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  58.86 
 
 
337 aa  308  9e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  56.8 
 
 
318 aa  291  7e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  47.12 
 
 
333 aa  246  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  47.51 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  47.57 
 
 
309 aa  243  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  47.19 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  51.06 
 
 
314 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  47.95 
 
 
340 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  47.85 
 
 
324 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  45.85 
 
 
323 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  46.18 
 
 
323 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  47.85 
 
 
324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  47.78 
 
 
334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.83 
 
 
331 aa  232  7.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  44.37 
 
 
342 aa  228  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  43.83 
 
 
318 aa  228  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  47.1 
 
 
314 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2997  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  47.62 
 
 
324 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4062  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  47.62 
 
 
324 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3988  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  47.62 
 
 
324 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  41.01 
 
 
343 aa  225  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0196  putative branched-chain amino acid ABC transporter integral membrane subunit  47.62 
 
 
324 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.47626  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3373  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  47.62 
 
 
324 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1605  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  47.62 
 
 
324 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3269  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  47.52 
 
 
324 aa  225  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3045  inner-membrane translocator  46.18 
 
 
323 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.926794  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  45.51 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2463  inner-membrane translocator  47.84 
 
 
333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  47.18 
 
 
344 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3327  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.28 
 
 
324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  41.39 
 
 
322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  45.99 
 
 
323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3117  inner-membrane translocator  47.25 
 
 
333 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.433038  normal  0.848648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  47.78 
 
 
328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3518  inner-membrane translocator  48.64 
 
 
332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.507962 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1379  inner-membrane translocator  47.49 
 
 
317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  45.92 
 
 
330 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3516  inner-membrane translocator  45.51 
 
 
344 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  47.1 
 
 
334 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  48.1 
 
 
311 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  43.14 
 
 
339 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  49.65 
 
 
313 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  43.34 
 
 
323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0087  inner-membrane translocator  48.42 
 
 
324 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1398  inner-membrane translocator  47.54 
 
 
329 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  44.98 
 
 
332 aa  215  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  44.98 
 
 
332 aa  215  9e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.1 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1285  inner-membrane translocator  46.69 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168466  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  50.35 
 
 
313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5819  inner-membrane translocator  44.84 
 
 
329 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186482  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6725  inner-membrane translocator  45.49 
 
 
329 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  41.9 
 
 
323 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  43.17 
 
 
324 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3779  inner-membrane translocator  43.81 
 
 
349 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  44.48 
 
 
332 aa  208  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0105  inner-membrane translocator  47.52 
 
 
325 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127814  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2968  inner-membrane translocator  47.52 
 
 
325 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0087  inner-membrane translocator  47.52 
 
 
325 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410791  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.62 
 
 
656 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  42.81 
 
 
324 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  45.83 
 
 
340 aa  205  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  44.84 
 
 
342 aa  202  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  42.23 
 
 
358 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  45.65 
 
 
337 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  45.65 
 
 
337 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1713  inner-membrane translocator  44.76 
 
 
332 aa  195  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0542902  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  42.67 
 
 
339 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  47.94 
 
 
337 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3758  putative branched-chain amino acid transport permease  44.63 
 
 
327 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.241466 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  42.67 
 
 
339 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  41.61 
 
 
315 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1676  inner-membrane translocator  43.31 
 
 
323 aa  193  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102995  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4077  inner-membrane translocator  49.17 
 
 
335 aa  192  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  40.71 
 
 
319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  39.37 
 
 
351 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0059  inner-membrane translocator  44.37 
 
 
328 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0244383  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  40.07 
 
 
333 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  44.64 
 
 
339 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.02 
 
 
355 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4452  inner-membrane translocator  43 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2932  inner-membrane translocator  42.05 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8053  inner-membrane translocator  43 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3242  inner-membrane translocator  43.82 
 
 
329 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.194129  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.43 
 
 
315 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  39.78 
 
 
320 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  43.1 
 
 
339 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  39.57 
 
 
332 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4270  inner-membrane translocator  38.83 
 
 
325 aa  179  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  39.42 
 
 
328 aa  175  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  39.78 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  37.62 
 
 
632 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4209  inner-membrane translocator  40.97 
 
 
346 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0640071  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3829  inner-membrane translocator  38.79 
 
 
322 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4906  inner-membrane translocator  38.79 
 
 
322 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4752  inner-membrane translocator  39.66 
 
 
331 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  36.81 
 
 
346 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  41.34 
 
 
840 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>