More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0658 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  86.74 
 
 		 633 aa  1006    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  66.34 
 
 		 642 aa  768    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0859  inner-membrane translocator  68.28 
 
 		 629 aa  684    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  97.21 
 
 		 646 aa  1119    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0155  inner-membrane translocator  67.69 
 
 		 655 aa  704    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4063  inner-membrane translocator  66.99 
 
 		 632 aa  712    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141363  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 646 aa  1257    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0173  inner-membrane translocator  67.53 
 
 		 635 aa  706    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0422307  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4216  inner-membrane translocator  56.98 
 
 		 630 aa  618  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  56.04 
 
 		 637 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  54.23 
 
 		 628 aa  567  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  53.3 
 
 		 628 aa  542  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1977  inner-membrane translocator  53.38 
 
 		 626 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0584  inner-membrane translocator  50.73 
 
 		 613 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.625482  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3084  inner-membrane translocator  42.68 
 
 		 623 aa  396  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00985997  normal  0.0142053 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1616  inner-membrane translocator  44.34 
 
 		 622 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0311969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 652 aa  298  3e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.21 
 
 		 656 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6488  inner-membrane translocator  43.89 
 
 		 292 aa  187  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115929  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  38.56 
 
 		 297 aa  182  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  38.98 
 
 		 320 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  39.19 
 
 		 286 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 320 aa  171  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 342 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  42.63 
 
 		 305 aa  167  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  40 
 
 		 286 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 306 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  41.37 
 
 		 306 aa  163  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  37.09 
 
 		 289 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.68 
 
 		 603 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 358 aa  160  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  38.68 
 
 		 289 aa  161  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  37.87 
 
 		 286 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 603 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.72 
 
 		 315 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 318 aa  159  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  31.64 
 
 		 603 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 293 aa  158  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 285 aa  158  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  31.64 
 
 		 603 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  39.2 
 
 		 286 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  38.59 
 
 		 304 aa  157  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  35.21 
 
 		 330 aa  157  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 306 aa  157  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  35.13 
 
 		 328 aa  157  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 314 aa  156  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 346 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 328 aa  155  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 299 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 603 aa  154  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  37.87 
 
 		 286 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  37.87 
 
 		 286 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 308 aa  153  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  37 
 
 		 286 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  37.12 
 
 		 286 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3426  inner-membrane translocator  39.39 
 
 		 300 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 306 aa  151  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  37.95 
 
 		 305 aa  151  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 333 aa  150  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  39.54 
 
 		 336 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4609  inner-membrane translocator  38.96 
 
 		 329 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 293 aa  149  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 287 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 283 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5096  inner-membrane translocator  42.05 
 
 		 303 aa  147  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681438  normal  0.989251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 328 aa  147  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.76 
 
 		 290 aa  147  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  36.61 
 
 		 285 aa  147  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  37.83 
 
 		 305 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1013  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 298 aa  146  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.361525  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  36.58 
 
 		 286 aa  146  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  38.67 
 
 		 306 aa  146  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  37.09 
 
 		 337 aa  146  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  37.09 
 
 		 337 aa  146  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  34.19 
 
 		 852 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 286 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  37.09 
 
 		 339 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 346 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  37.12 
 
 		 315 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  37.78 
 
 		 337 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 287 aa  145  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 340 aa  145  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 313 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.64 
 
 		 331 aa  144  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3321  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 293 aa  143  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 293 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 287 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0096  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.77 
 
 		 607 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26664 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 306 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1398  inner-membrane translocator  33.63 
 
 		 329 aa  141  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4487  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 306 aa  142  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4209  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 346 aa  141  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0640071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 343 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 287 aa  141  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  34.05 
 
 		 343 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 333 aa  141  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 340 aa  140  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2459  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 308 aa  140  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 314 aa  140  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  38.11 
 
 		 313 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>