More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2122 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  100 
 
 		 304 aa  585  1e-166  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  58.54 
 
 		 315 aa  323  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  52.94 
 
 		 315 aa  278  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5129  inner-membrane translocator  56.83 
 
 		 306 aa  266  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0107834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0634  inner-membrane translocator  47.02 
 
 		 324 aa  258  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4608  inner-membrane translocator  55 
 
 		 316 aa  258  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0364  inner-membrane translocator  50.86 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4486  inner-membrane translocator  54.03 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3172  inner-membrane translocator  54.49 
 
 		 336 aa  241  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0411504  normal  0.957226 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  49.31 
 
 		 313 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0792  inner-membrane translocator  44.86 
 
 		 335 aa  226  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.756221 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3828  inner-membrane translocator  48.58 
 
 		 320 aa  226  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4399  inner-membrane translocator  47.81 
 
 		 333 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  46.31 
 
 		 340 aa  222  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4209  inner-membrane translocator  45.33 
 
 		 346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0640071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0177  inner-membrane translocator  44.18 
 
 		 333 aa  218  7.999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2458  inner-membrane translocator  41.96 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  44.3 
 
 		 368 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4000  inner-membrane translocator  48.1 
 
 		 337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0988  inner-membrane translocator  44.79 
 
 		 349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000237918 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  44.26 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4045  inner-membrane translocator  58.57 
 
 		 315 aa  209  6e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5097  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282354  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  42.14 
 
 		 594 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  41.37 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  44.88 
 
 		 322 aa  199  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  41.07 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  42.57 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3641  inner-membrane translocator  49.29 
 
 		 334 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1210  inner-membrane translocator  52.92 
 
 		 334 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  43.9 
 
 		 320 aa  195  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1905  inner-membrane translocator  46.15 
 
 		 338 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  40.4 
 
 		 346 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  43.1 
 
 		 343 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  43.99 
 
 		 361 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  42.09 
 
 		 314 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  40.28 
 
 		 340 aa  189  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 335 aa  188  8e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  41.04 
 
 		 309 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  42.38 
 
 		 337 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  43.36 
 
 		 597 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  41.69 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3087  inner-membrane translocator  45.3 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.878842  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  43.48 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  42.6 
 
 		 340 aa  186  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0085  inner-membrane translocator  41.86 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  42.27 
 
 		 332 aa  186  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  40.93 
 
 		 329 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  42.34 
 
 		 344 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  42.21 
 
 		 328 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  39.39 
 
 		 323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  42.24 
 
 		 337 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  42.24 
 
 		 337 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  44.3 
 
 		 340 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  44.44 
 
 		 339 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  39.29 
 
 		 314 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  41.7 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  43.38 
 
 		 337 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  40.34 
 
 		 333 aa  179  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.05 
 
 		 331 aa  178  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  41.47 
 
 		 342 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  41.82 
 
 		 328 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1228  inner-membrane translocator  47.47 
 
 		 354 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0580355  normal  0.0656558 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  40.83 
 
 		 652 aa  175  7e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  39.04 
 
 		 346 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  40.28 
 
 		 339 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  40.07 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  40.28 
 
 		 339 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  43.12 
 
 		 330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1379  inner-membrane translocator  40.49 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  41.7 
 
 		 313 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  38.99 
 
 		 332 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  38.99 
 
 		 332 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  39.67 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  41.37 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.68 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3779  inner-membrane translocator  43.77 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.93 
 
 		 656 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1331  inner-membrane translocator  46.1 
 
 		 363 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412363  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0059  inner-membrane translocator  41.43 
 
 		 328 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0244383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  41.27 
 
 		 324 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  41.58 
 
 		 339 aa  168  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  41.27 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  39.49 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.71 
 
 		 355 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5819  inner-membrane translocator  38.55 
 
 		 329 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186482  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  42.21 
 
 		 306 aa  165  9e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3516  inner-membrane translocator  39.69 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  37.14 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  41.28 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  37.96 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  37.14 
 
 		 328 aa  163  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  35.05 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1713  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0542902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.65 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1398  inner-membrane translocator  40.43 
 
 		 329 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 338 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>