More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2014 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2014  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 
333 aa  657    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.383431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1770  branched chain amino acid ABC transporter, permease  98.5 
 
 
333 aa  649    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1753  branched chain amino acid ABC transporter, permease  98.2 
 
 
333 aa  648    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.20801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1971  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  98.2 
 
 
333 aa  647    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000553535 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2035  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  98.5 
 
 
333 aa  650    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.226919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1935  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  97.9 
 
 
333 aa  623  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1796  branched-chain amino acid ABC transporter permease  97.9 
 
 
333 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137284  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1936  branched chain amino acid ABC transporter permease  97.9 
 
 
333 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3407  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  94.3 
 
 
298 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000473911 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1805  inner-membrane translocator  93.99 
 
 
333 aa  555  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2422  inner-membrane translocator  36.05 
 
 
355 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3800  inner-membrane translocator  35.14 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0326  inner-membrane translocator  33.24 
 
 
359 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660469  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4060  inner-membrane translocator  36.44 
 
 
355 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0299219  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2555  inner-membrane translocator  36.25 
 
 
355 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0880453  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.34 
 
 
331 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1982  inner-membrane translocator  35.38 
 
 
358 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2061  inner-membrane translocator  34.21 
 
 
355 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427739  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  32.85 
 
 
358 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  34.5 
 
 
339 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  34.5 
 
 
339 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7686  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.35 
 
 
356 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361538  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  34.98 
 
 
330 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  35.15 
 
 
309 aa  159  7e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  33.68 
 
 
332 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1370  inner-membrane translocator  35.59 
 
 
358 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  33 
 
 
329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  30.74 
 
 
340 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.81 
 
 
315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  35.22 
 
 
322 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  29.52 
 
 
324 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  34.02 
 
 
337 aa  153  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  36.71 
 
 
323 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  35.97 
 
 
338 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
320 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
320 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  34.31 
 
 
324 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4208  inner-membrane translocator  36.04 
 
 
355 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  32.98 
 
 
332 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  32.98 
 
 
332 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  30.29 
 
 
344 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1398  inner-membrane translocator  35.34 
 
 
329 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4886  inner-membrane translocator  34.69 
 
 
355 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
361 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  32.7 
 
 
652 aa  149  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  34.71 
 
 
339 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  31.96 
 
 
323 aa  149  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  31.78 
 
 
594 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6725  inner-membrane translocator  33.57 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  33.66 
 
 
324 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1046  inner-membrane translocator  33.98 
 
 
352 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  32.42 
 
 
333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5819  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
329 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186482  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4108  inner-membrane translocator  34.48 
 
 
361 aa  145  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  31.33 
 
 
342 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0943  inner-membrane translocator  32.8 
 
 
351 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  32.2 
 
 
368 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  31.45 
 
 
340 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1713  inner-membrane translocator  36.04 
 
 
332 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0542902  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  31.16 
 
 
334 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  32.73 
 
 
323 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4270  inner-membrane translocator  32.14 
 
 
325 aa  142  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  31.85 
 
 
333 aa  142  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  32.42 
 
 
335 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  34.13 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  31.89 
 
 
337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  31.23 
 
 
346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  31.17 
 
 
340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  30.16 
 
 
314 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  28.92 
 
 
328 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  30.77 
 
 
332 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  32.51 
 
 
315 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  31.46 
 
 
332 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  33.11 
 
 
318 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  31.47 
 
 
306 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  31.86 
 
 
632 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4399  inner-membrane translocator  32.46 
 
 
333 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  31.08 
 
 
327 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  31.66 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  32.26 
 
 
597 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3045  inner-membrane translocator  32.82 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.926794  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  29.45 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  31.33 
 
 
852 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  32.67 
 
 
323 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  31.23 
 
 
314 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  29.87 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3516  inner-membrane translocator  30.77 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  30.86 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.33 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  34.3 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  32.88 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  32.73 
 
 
315 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1513  inner-membrane translocator  27.27 
 
 
399 aa  134  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  31.67 
 
 
628 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0195  inner-membrane translocator  34.77 
 
 
337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  32.49 
 
 
319 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  32.34 
 
 
334 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.42 
 
 
355 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  29.22 
 
 
646 aa  132  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>