More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1673 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1673  urea ABC transporter, permease protein UrtB  100 
 
 		 292 aa  550  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  71.82 
 
 		 292 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  66.22 
 
 		 296 aa  379  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3799  inner-membrane translocator  58.65 
 
 		 294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2337  inner-membrane translocator  59.02 
 
 		 294 aa  301  9e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240816  normal  0.250903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2329  inner-membrane translocator  59.02 
 
 		 294 aa  301  9e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21186  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2290  inner-membrane translocator  59.02 
 
 		 294 aa  301  9e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2595  inner-membrane translocator  59.02 
 
 		 294 aa  299  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  50.17 
 
 		 297 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0701  urea ABC transporter, permease protein UrtB  61.05 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.879979  hitchhiker  0.000000462234 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1822  inner-membrane translocator  54.08 
 
 		 302 aa  292  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.564217  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  53.47 
 
 		 524 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  53.12 
 
 		 524 aa  279  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  53.12 
 
 		 526 aa  277  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1085  urea ABC transporter, permease protein UrtB  53.63 
 
 		 528 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  52.94 
 
 		 527 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  46.6 
 
 		 542 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3499  inner-membrane translocator  52.35 
 
 		 526 aa  255  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0700  inner-membrane translocator  53.87 
 
 		 522 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3317  urea ABC transporter, permease protein UrtB  48.56 
 
 		 545 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321889  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4011  urea ABC transporter, permease protein UrtB  50 
 
 		 515 aa  252  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.430688  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3062  urea ABC transporter, permease protein UrtB  49.1 
 
 		 550 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4185  inner-membrane translocator  48.2 
 
 		 537 aa  251  8.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.940988  normal  0.195326 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  47.89 
 
 		 547 aa  251  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  48.28 
 
 		 548 aa  250  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1201  inner-membrane translocator  48.1 
 
 		 527 aa  249  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4720  inner-membrane translocator  54.24 
 
 		 484 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149683  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0589  inner-membrane translocator  52.53 
 
 		 500 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.892329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4606  urea ABC transporter, permease protein UrtB  46.88 
 
 		 558 aa  248  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4427  inner-membrane translocator  51.52 
 
 		 529 aa  248  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483913  normal  0.930967 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1989  inner-membrane translocator  49.82 
 
 		 524 aa  248  7e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.517253  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0953  inner-membrane translocator  50.18 
 
 		 545 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.794484  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1422  inner-membrane translocator  52.77 
 
 		 526 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4842  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  53.87 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25148  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4228  urea ABC transporter, permease protein UrtB  49.02 
 
 		 551 aa  247  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0420008  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  47.26 
 
 		 534 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4899  urea ABC transporter, permease protein UrtB  53.87 
 
 		 495 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2619  urea ABC transporter, permease protein UrtB  47.57 
 
 		 545 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.098179 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1795  inner-membrane translocator  47.48 
 
 		 542 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.526146  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4150  inner-membrane translocator  48.56 
 
 		 545 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64280  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  53.14 
 
 		 529 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00501395  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4886  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  51.92 
 
 		 529 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3509  inner-membrane translocator  48.03 
 
 		 542 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4634  urea ABC transporter, permease protein UrtB  53.51 
 
 		 495 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.23273  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  48.66 
 
 		 523 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619152  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0953  urea ABC transporter, permease protein UrtB  49.45 
 
 		 549 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3701  inner-membrane translocator  47.67 
 
 		 537 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2696  inner-membrane translocator  48.39 
 
 		 554 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.665567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2160  urea ABC transporter, permease protein UrtB  49.08 
 
 		 539 aa  242  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361023  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3866  inner-membrane translocator  45.12 
 
 		 308 aa  242  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3932  urea ABC transporter, permease protein UrtB  49.64 
 
 		 543 aa  241  7.999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  45.92 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7017  branched chain amino acid ABC transporter permease  46.95 
 
 		 520 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.470774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1503  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  50.36 
 
 		 542 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0128621  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3684  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  49.08 
 
 		 552 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0949  inner-membrane translocator  47.81 
 
 		 540 aa  240  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4190  urea ABC transporter, permease protein UrtB  47.31 
 
 		 537 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0698  putative branched-chain amino acid transport system, permease component  50.17 
 
 		 534 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0832776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1256  branched-chain amino acid ABC transporter, permease component  46.55 
 
 		 543 aa  240  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.897203  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0987  inner-membrane translocator  49.45 
 
 		 553 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573252  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  47.89 
 
 		 551 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0977  urea ABC transporter, permease protein UrtB  45.3 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2204  inner-membrane translocator  47.14 
 
 		 300 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3128  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  50 
 
 		 542 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2177  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  50 
 
 		 540 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281547  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2974  putative branched-chain amino acid transport system permease protein  44.22 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2564  putative amino acid ABC transporter, permease protein  50 
 
 		 540 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10716  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00882  Branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  47.81 
 
 		 538 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3104  putative amino acid ABC transporter, permease protein  50 
 
 		 542 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2049  putative amino acid ABC transporter, permease protein  50 
 
 		 538 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81771  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0731  putative amino acid ABC transporter, permease protein  50 
 
 		 538 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2417  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.42 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3068  putative amino acid ABC transporter, permease protein  48.91 
 
 		 542 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1774  inner-membrane translocator  44.76 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.682783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  49.08 
 
 		 539 aa  236  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4077  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.88 
 
 		 293 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2483  urea ABC transporter, permease protein UrtB  48.72 
 
 		 540 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0594  urea ABC transporter, permease protein UrtB  45.3 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2192  urea ABC transporter, permease protein UrtB  46.93 
 
 		 543 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788858  normal  0.150226 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2745  urea ABC transporter, permease protein UrtB  47.64 
 
 		 525 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4013  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  47.79 
 
 		 539 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0879  urea ABC transporter, permease protein UrtB  47.79 
 
 		 539 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0786  inner-membrane translocator  47.43 
 
 		 539 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0797  urea ABC transporter, permease protein UrtB  47.43 
 
 		 539 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3863  inner-membrane translocator  44.1 
 
 		 308 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.343461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0430  inner-membrane translocator  47.79 
 
 		 539 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0909  inner-membrane translocator  47.79 
 
 		 539 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2793  hydrophobic amino acid ABC transporter permease  51.29 
 
 		 515 aa  232  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1253  inner-membrane translocator  44.1 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27605 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2872  urea ABC transporter, permease protein UrtB  51.29 
 
 		 533 aa  232  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0183692  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1339  hydrophobic amino acid ABC transporter permease  51.29 
 
 		 533 aa  232  6e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.388899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0655  branched chain amino acid ABC transporter permease  44.79 
 
 		 308 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.481905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5511  urea ABC transporter, permease protein UrtB  45.64 
 
 		 308 aa  232  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1869  urea ABC transporter, permease protein UrtB  46.93 
 
 		 543 aa  231  9e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.180379  normal  0.303887 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  44.1 
 
 		 308 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2040  ABC transporter permease  46.38 
 
 		 538 aa  229  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.552564  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5580  branched-chain amino acid ABC transporter permease  54.24 
 
 		 529 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3380  urea ABC transporter, permease protein UrtB  43.9 
 
 		 308 aa  229  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4909  inner-membrane translocator  45.7 
 
 		 300 aa  228  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3571  urea ABC transporter, permease protein UrtB  43.21 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>