More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4107 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4107  inner-membrane translocator  100 
 
 		 519 aa  1006    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.758696  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  37.87 
 
 		 286 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  38.6 
 
 		 286 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1795  branched-chain amino acid ABC transporter permease  38.24 
 
 		 286 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1970  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 		 286 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000947675 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1935  branched chain amino acid ABC transporter permease  38.24 
 
 		 286 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  35 
 
 		 286 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3802  inner-membrane translocator  47.95 
 
 		 315 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  35.82 
 
 		 628 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1804  inner-membrane translocator  38.24 
 
 		 286 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391263  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2176  inner-membrane translocator  37.92 
 
 		 340 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.817413  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 652 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2013  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 		 286 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 304 aa  117  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2034  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 		 284 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.191012  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 297 aa  116  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3408  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.87 
 
 		 286 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000427982 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1934  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.87 
 
 		 286 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  32.51 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  32.51 
 
 		 290 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  32.53 
 
 		 336 aa  113  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  34.14 
 
 		 628 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4216  inner-membrane translocator  36.15 
 
 		 630 aa  110  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 289 aa  110  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2529  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 345 aa  109  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.658317  normal  0.422906 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 637 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2810  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 291 aa  107  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144743  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 306 aa  106  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 287 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2554  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 330 aa  105  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639448  normal  0.862916 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2062  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 353 aa  105  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.813813  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 287 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 286 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2421  inner-membrane translocator  32.95 
 
 		 327 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719223  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  35.11 
 
 		 287 aa  103  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0077  branched-chain amino acid ABC transporter permease protein  35.46 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  35.18 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4207  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0041  inner-membrane translocator  37.84 
 
 		 299 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00123525  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 299 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 642 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 290 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.79 
 
 		 290 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0420  inner-membrane translocator  37.14 
 
 		 288 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4265  inner-membrane translocator  30.23 
 
 		 291 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271034  decreased coverage  0.00000610723 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  34.66 
 
 		 286 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3459  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 289 aa  100  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.411869  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1051  inner-membrane translocator  32.24 
 
 		 289 aa  100  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4700  inner-membrane translocator  33.74 
 
 		 296 aa  100  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.365465  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2390  inner-membrane translocator  32.47 
 
 		 315 aa  99.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0318684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7685  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32 
 
 		 336 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350264  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3913  inner-membrane translocator  36.97 
 
 		 292 aa  99  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.188652  normal  0.0711399 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0953  inner-membrane translocator  28.11 
 
 		 545 aa  97.4  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.794484  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2417  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.04 
 
 		 293 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 308 aa  97.1  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  36.32 
 
 		 306 aa  96.7  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2204  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 300 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1201  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 527 aa  96.3  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1503  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.49 
 
 		 542 aa  96.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0128621  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 306 aa  96.3  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 305 aa  96.3  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 306 aa  96.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  36.41 
 
 		 285 aa  96.3  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  33.09 
 
 		 296 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4885  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 341 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 291 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  33.09 
 
 		 296 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0328  inner-membrane translocator  35.98 
 
 		 327 aa  95.1  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.59084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0431  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.71 
 
 		 291 aa  95.1  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00135798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2192  urea ABC transporter, permease protein UrtB  28.92 
 
 		 543 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788858  normal  0.150226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1869  urea ABC transporter, permease protein UrtB  28.51 
 
 		 543 aa  94.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.180379  normal  0.303887 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4558  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 288 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.815893  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  36.63 
 
 		 291 aa  94  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1596  urea ABC transporter, permease protein UrtB  26.24 
 
 		 308 aa  93.6  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 293 aa  93.6  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0225  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 317 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  40.76 
 
 		 288 aa  93.6  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1795  inner-membrane translocator  28.82 
 
 		 542 aa  93.6  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.526146  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6329  inner-membrane translocator  30.48 
 
 		 289 aa  93.2  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3932  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30 
 
 		 543 aa  92.8  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 293 aa  92.8  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 286 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1983  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 341 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2760  inner-membrane translocator  33.86 
 
 		 335 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  31.66 
 
 		 305 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  33.59 
 
 		 290 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1945  inner-membrane translocator  33.47 
 
 		 335 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 315 aa  92.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3757  putative branched-chain amino acid transport permease  31.32 
 
 		 295 aa  92.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 633 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2177  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  28.57 
 
 		 540 aa  91.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281547  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2745  urea ABC transporter, permease protein UrtB  30.5 
 
 		 525 aa  92  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0731  putative amino acid ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 538 aa  91.7  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  32.55 
 
 		 305 aa  91.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2564  putative amino acid ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 540 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10716  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3068  putative amino acid ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 542 aa  91.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2049  putative amino acid ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 538 aa  91.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81771  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1753  inner-membrane translocator  29.84 
 
 		 291 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1573  inner-membrane translocator  31.11 
 
 		 315 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1587  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 288 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>