More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0703 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0703  inner-membrane translocator  100 
 
 		 292 aa  534  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0248048  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0761  inner-membrane translocator  90.07 
 
 		 292 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2847  inner-membrane translocator  46.45 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.313768  normal  0.521015 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  40.29 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 287 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  38.1 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  39.55 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  40.94 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3690  inner-membrane translocator  45.09 
 
 		 610 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00194124  normal  0.651023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 293 aa  152  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  40 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  45.95 
 
 		 306 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 305 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3318  inner-membrane translocator  43.21 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  40.08 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  36.23 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  39.3 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4487  inner-membrane translocator  40.08 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  35.77 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  41.8 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  43.13 
 
 		 306 aa  135  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3088  inner-membrane translocator  38.02 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  39.61 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 283 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0852  inner-membrane translocator  36.8 
 
 		 288 aa  132  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147102  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  35.13 
 
 		 290 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  38.15 
 
 		 306 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  35.13 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.77 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2459  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  34.16 
 
 		 289 aa  125  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 290 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  40.47 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5096  inner-membrane translocator  40.39 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681438  normal  0.989251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  37.31 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0146  inner-membrane translocator  35.21 
 
 		 291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000678204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5445  ABC transporter membrane spanning protein  35.02 
 
 		 285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2236  inner-membrane translocator  39.69 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.5 
 
 		 290 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0649  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.74 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3731  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.76 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0431  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.51 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00135798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2688  inner-membrane translocator  40 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00282736  normal  0.252388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  37.68 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0365  inner-membrane translocator  39.29 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 628 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3674  putative urea/short-chain amide transport system permease protein  34.06 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  39.61 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4265  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271034  decreased coverage  0.00000610723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  34.12 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  37.09 
 
 		 291 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1453  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0626411  hitchhiker  0.000392486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1494  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1364  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0176  inner-membrane translocator  38.58 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3476  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4400  inner-membrane translocator  37.3 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3184  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 287 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.819999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0635  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1178  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1580  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1587  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  33.2 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4108  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4044  inner-membrane translocator  38.25 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4558  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 288 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.815893  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4609  inner-membrane translocator  38.98 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0194  inner-membrane translocator  39.65 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2390  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 315 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0318684  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2554  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639448  normal  0.862916 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0861  inner-membrane translocator  37.13 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.220727  normal  0.159133 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  33.69 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1353  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 301 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4271  inner-membrane translocator  33.82 
 
 		 314 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  32.98 
 
 		 628 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1616  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 622 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0311969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4218  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.745671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3902  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  35.32 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83606  normal  0.194602 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4700  inner-membrane translocator  35.75 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.365465  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6488  inner-membrane translocator  35.11 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>