More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2847 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2847  inner-membrane translocator  100 
 
 		 289 aa  539  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.313768  normal  0.521015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3690  inner-membrane translocator  58.16 
 
 		 610 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00194124  normal  0.651023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3318  inner-membrane translocator  50.18 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0703  inner-membrane translocator  47.45 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0248048  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 287 aa  169  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  40.4 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  39.79 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  39.2 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  39.79 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  39.3 
 
 		 288 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  40.65 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3088  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 288 aa  155  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 287 aa  155  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  37.12 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  38.28 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0852  inner-membrane translocator  39.18 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147102  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  39.3 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  39.25 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  38.52 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  40.91 
 
 		 288 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  36.75 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  36.15 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 628 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  35.43 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  36.15 
 
 		 336 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  36.07 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  40.41 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4487  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  35.89 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2459  inner-membrane translocator  36.03 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0761  inner-membrane translocator  45.1 
 
 		 292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0365  inner-membrane translocator  36.58 
 
 		 306 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1580  inner-membrane translocator  32.03 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1587  inner-membrane translocator  31.67 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4558  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.815893  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3802  inner-membrane translocator  37.12 
 
 		 315 aa  125  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0176  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4609  inner-membrane translocator  39.85 
 
 		 329 aa  125  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  34.98 
 
 		 628 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2390  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 315 aa  122  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0318684  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5096  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681438  normal  0.989251 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  35.27 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5445  ABC transporter membrane spanning protein  34.55 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1453  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0626411  hitchhiker  0.000392486 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1494  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 330 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  36.97 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5706  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  32.86 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.956551 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.16 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1400  inner-membrane translocator  36.15 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704678  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2062  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 353 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.813813  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1861  inner-membrane translocator  36.29 
 
 		 323 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221374 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4400  inner-membrane translocator  35.55 
 
 		 304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3084  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 623 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00985997  normal  0.0142053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1573  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 315 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1013  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.361525  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1579  inner-membrane translocator  32.6 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.687848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4044  inner-membrane translocator  36.82 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 289 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0665  branched chain amino acid ABC transporter permease  34.02 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.07 
 
 		 290 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2236  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 306 aa  112  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4565  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 315 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3731  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 637 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1616  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 622 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0311969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  35.42 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0649  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.88 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2554  inner-membrane translocator  32.13 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639448  normal  0.862916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1178  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 288 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2577  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 329 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.541212  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6574  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0310358  normal  0.0403201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3426  inner-membrane translocator  35.36 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>