More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3690 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3690  inner-membrane translocator  100 
 
 		 610 aa  1147    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00194124  normal  0.651023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2847  inner-membrane translocator  58.16 
 
 		 289 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.313768  normal  0.521015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2848  inner-membrane translocator  53.51 
 
 		 337 aa  262  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.525645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  31.34 
 
 		 628 aa  217  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3318  inner-membrane translocator  48.6 
 
 		 297 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4216  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 630 aa  189  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3319  inner-membrane translocator  43.89 
 
 		 329 aa  188  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  31.63 
 
 		 637 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  29.68 
 
 		 628 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  40.44 
 
 		 286 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0703  inner-membrane translocator  44.92 
 
 		 292 aa  166  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0248048  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 287 aa  160  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1616  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 622 aa  160  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0311969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3084  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 623 aa  157  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00985997  normal  0.0142053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  29.95 
 
 		 642 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  37.19 
 
 		 289 aa  151  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 287 aa  150  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.39 
 
 		 656 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 306 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 305 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3088  inner-membrane translocator  39.38 
 
 		 288 aa  147  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 287 aa  147  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 287 aa  147  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  37.36 
 
 		 308 aa  147  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 293 aa  146  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  38.04 
 
 		 288 aa  145  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  36.92 
 
 		 305 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  36.11 
 
 		 293 aa  144  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  37.87 
 
 		 306 aa  143  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2459  inner-membrane translocator  39.44 
 
 		 308 aa  143  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0852  inner-membrane translocator  37.78 
 
 		 288 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  39.15 
 
 		 306 aa  142  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 315 aa  141  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 304 aa  141  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1580  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 288 aa  140  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0176  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 306 aa  140  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 288 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 290 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4558  inner-membrane translocator  36.26 
 
 		 288 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.815893  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1587  inner-membrane translocator  35.61 
 
 		 288 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  28.89 
 
 		 633 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  37.65 
 
 		 306 aa  137  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0761  inner-membrane translocator  44.37 
 
 		 292 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 313 aa  136  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  36.7 
 
 		 306 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  35.21 
 
 		 290 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  35.84 
 
 		 286 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  36.82 
 
 		 286 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 286 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0584  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 613 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.625482  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  36.62 
 
 		 288 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  36.16 
 
 		 297 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 288 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  26.51 
 
 		 652 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  35.98 
 
 		 305 aa  130  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 290 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 290 aa  129  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1977  inner-membrane translocator  30.24 
 
 		 626 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  36.03 
 
 		 306 aa  127  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 306 aa  127  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3184  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 287 aa  126  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.819999 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 285 aa  126  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  26.48 
 
 		 646 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 286 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5096  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 303 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681438  normal  0.989251 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 286 aa  125  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.48 
 
 		 646 aa  125  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 291 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4400  inner-membrane translocator  38.37 
 
 		 304 aa  124  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 283 aa  124  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0365  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 306 aa  123  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 286 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 299 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2565  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.59 
 
 		 286 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4487  inner-membrane translocator  36.55 
 
 		 306 aa  122  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4063  inner-membrane translocator  28.35 
 
 		 632 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141363  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5706  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  34.84 
 
 		 289 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.956551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.06 
 
 		 603 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0155  inner-membrane translocator  29.15 
 
 		 655 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 291 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6573  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 286 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0445304  hitchhiker  0.00930416 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 289 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0173  inner-membrane translocator  29.46 
 
 		 635 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0422307  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4609  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 329 aa  118  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  29.62 
 
 		 603 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6574  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 286 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0310358  normal  0.0403201 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4296  inner-membrane translocator  31.48 
 
 		 289 aa  116  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  34.36 
 
 		 336 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4007  inner-membrane translocator  39.26 
 
 		 287 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3731  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 289 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 286 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4558  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.07 
 
 		 311 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2390  inner-membrane translocator  35.21 
 
 		 315 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0318684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 286 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 286 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3476  inner-membrane translocator  31.18 
 
 		 287 aa  114  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0649  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.49 
 
 		 289 aa  114  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0665  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.33 
 
 		 297 aa  114  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.99 
 
 		 315 aa  114  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3383  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 290 aa  113  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0509603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>