More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3902 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3902  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  100 
 
 		 297 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83606  normal  0.194602 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3575  inner-membrane translocator  88.32 
 
 		 291 aa  461  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  62.59 
 
 		 291 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  61.77 
 
 		 293 aa  333  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  60.96 
 
 		 291 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  61.05 
 
 		 291 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4700  inner-membrane translocator  60.27 
 
 		 296 aa  288  5.0000000000000004e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.365465  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  46.05 
 
 		 289 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0053  inner-membrane translocator  42.7 
 
 		 291 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8565  inner-membrane translocator  43.71 
 
 		 289 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0330607  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  43.26 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1804  inner-membrane translocator  40.91 
 
 		 293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  40.6 
 
 		 287 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  41.7 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.4 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 286 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.4 
 
 		 295 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 286 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  41.32 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 287 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1051  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3459  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.411869  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3519  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  41.9 
 
 		 286 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  42.76 
 
 		 285 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1399  inner-membrane translocator  36.95 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  39.79 
 
 		 652 aa  169  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1714  inner-membrane translocator  36.61 
 
 		 295 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0374994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4026  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 295 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  40.97 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3294  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  36.24 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0420921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  37.71 
 
 		 290 aa  167  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3165  inner-membrane translocator  40.16 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.21 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0058  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  41.13 
 
 		 288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  36.7 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3594  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.577522 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  39.08 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3530  inner-membrane translocator  39.79 
 
 		 294 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.902092  normal  0.626427 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3757  putative branched-chain amino acid transport permease  34.55 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4271  inner-membrane translocator  40.21 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  39.78 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  39.78 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2331  inner-membrane translocator  39.36 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1675  inner-membrane translocator  38.71 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3243  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.577561  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  36.7 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2519  inner-membrane translocator  38.96 
 
 		 291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964633  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2565  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.99 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.63 
 
 		 294 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  38.7 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6434  inner-membrane translocator  35.04 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.263735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4451  inner-membrane translocator  34.72 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2867  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0086  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3517  inner-membrane translocator  36.75 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8052  inner-membrane translocator  34.72 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2937  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.28 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  39.79 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3328  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.26 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0088  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 294 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2031  inner-membrane translocator  38.72 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0077  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 294 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981824  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1606  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  34.28 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0197  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.28 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4063  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  34.28 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2996  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  34.28 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.38 
 
 		 656 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3989  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  34.28 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3374  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  34.28 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3210  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 294 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1453  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 330 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0626411  hitchhiker  0.000392486 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 320 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 320 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1494  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 330 aa  158  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3341  transmembrane ABC transporter protein  33.55 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3758  putative ABC transporter, permease protein  36.69 
 
 		 287 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4078  inner-membrane translocator  40.14 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 288 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  34.4 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2582  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.496751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3674  putative urea/short-chain amide transport system permease protein  37.94 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  36.29 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3536  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 294 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0293486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0020  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.62 
 
 		 294 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0009  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.978164  normal  0.0292693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0548  inner-membrane translocator  40.86 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3368  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6573  inner-membrane translocator  40.99 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0445304  hitchhiker  0.00930416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>