More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1364 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1364  inner-membrane translocator  100 
 
 		 290 aa  559  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3731  inner-membrane translocator  49.82 
 
 		 289 aa  277  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0649  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  49.47 
 
 		 289 aa  277  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3184  inner-membrane translocator  49.3 
 
 		 287 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.819999 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4218  inner-membrane translocator  49.47 
 
 		 287 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.745671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3476  inner-membrane translocator  47.54 
 
 		 287 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4558  inner-membrane translocator  46.48 
 
 		 288 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.815893  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1580  inner-membrane translocator  45.77 
 
 		 288 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1587  inner-membrane translocator  45.07 
 
 		 288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1178  inner-membrane translocator  45.61 
 
 		 288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2271  inner-membrane translocator  46.32 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.921298  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1748  inner-membrane translocator  47.39 
 
 		 290 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5706  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  47.35 
 
 		 289 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.956551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3383  inner-membrane translocator  47.39 
 
 		 290 aa  225  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0509603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0289  inner-membrane translocator  46.69 
 
 		 290 aa  223  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4007  inner-membrane translocator  51.58 
 
 		 287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0160  inner-membrane translocator  47.75 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2729  inner-membrane translocator  46.69 
 
 		 290 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279205  decreased coverage  0.00299657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4296  inner-membrane translocator  45.8 
 
 		 289 aa  217  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2060  inner-membrane translocator  49.65 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2453  inner-membrane translocator  49.3 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.768144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4781  putative branched-chain amino acid ABC transport system permease  50.7 
 
 		 288 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0372095  normal  0.329091 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2248  transmembrane ABC transporter protein  49.12 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5149  inner-membrane translocator  46.49 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5445  ABC transporter membrane spanning protein  43.46 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  40.29 
 
 		 286 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  36.4 
 
 		 287 aa  175  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2937  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.44 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3989  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  35.44 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0197  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.44 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3374  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  35.44 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1606  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  35.44 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4063  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  35.44 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2996  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  35.44 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 294 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0020  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.34 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.34 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3328  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.74 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0088  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0077  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981824  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0086  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 294 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  35.13 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  35.13 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3368  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3046  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 294 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6434  inner-membrane translocator  35.58 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.263735  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3757  putative branched-chain amino acid transport permease  35.61 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2331  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3517  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 293 aa  158  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3165  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3758  putative ABC transporter, permease protein  35.17 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  35 
 
 		 652 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1675  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 290 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3594  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.577522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 313 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2519  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 291 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964633  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3536  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 294 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0293486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 290 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4451  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3243  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.577561  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  38.49 
 
 		 285 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8052  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  33.82 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.67 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3210  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0058  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 299 aa  152  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0194  inner-membrane translocator  41.58 
 
 		 289 aa  151  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.13 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.13 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2952  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0349553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3306  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 295 aa  149  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.605647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3341  transmembrane ABC transporter protein  33.22 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3294  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  35.66 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0420921  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  34.89 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  34.91 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4026  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  38.27 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3780  inner-membrane translocator  37.08 
 
 		 294 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 308 aa  145  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3519  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  33.57 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1714  inner-membrane translocator  33.57 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0374994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3484  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6268  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.770597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>