More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6090 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6573  inner-membrane translocator  98.27 
 
 		 347 aa  660    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176253  normal  0.0417549 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5726  inner-membrane translocator  100 
 
 		 347 aa  671    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6090  inner-membrane translocator  100 
 
 		 347 aa  671    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  80.99 
 
 		 351 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  82.89 
 
 		 355 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  73.82 
 
 		 332 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  74.34 
 
 		 333 aa  440  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  76.6 
 
 		 319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3460  inner-membrane translocator  74.67 
 
 		 335 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4906  inner-membrane translocator  70.77 
 
 		 322 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3829  inner-membrane translocator  70.77 
 
 		 322 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4752  inner-membrane translocator  72.54 
 
 		 331 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4270  inner-membrane translocator  65.02 
 
 		 325 aa  360  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  58.81 
 
 		 339 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  58.81 
 
 		 339 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0759  inner-membrane translocator  65.48 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  59.55 
 
 		 339 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3210  inner-membrane translocator  58.02 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.756428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  45.77 
 
 		 838 aa  212  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  42.02 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  39.55 
 
 		 852 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  46.45 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  44.48 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  44.48 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.07 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  39.54 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  39.75 
 
 		 840 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  41.3 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  39.45 
 
 		 332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  42.59 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  40.38 
 
 		 346 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  44.77 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  37.71 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  40.93 
 
 		 314 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  36.19 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  43.12 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  39.46 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  41.42 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 318 aa  170  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  38.18 
 
 		 328 aa  169  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 324 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 324 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  37.92 
 
 		 314 aa  169  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  37.02 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2932  inner-membrane translocator  40.29 
 
 		 311 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  43.12 
 
 		 313 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.46 
 
 		 323 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  36.39 
 
 		 632 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  39.12 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  42.16 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.91 
 
 		 331 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  35.31 
 
 		 842 aa  165  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  39.3 
 
 		 621 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  38.94 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3045  inner-membrane translocator  35.78 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.926794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3269  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.1 
 
 		 324 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 322 aa  162  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  39.25 
 
 		 333 aa  162  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  37.24 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  37.88 
 
 		 327 aa  162  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  41.04 
 
 		 328 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  41.61 
 
 		 311 aa  160  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  39.48 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3779  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 349 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  37.23 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  33.85 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  40.4 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.7 
 
 		 656 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.82 
 
 		 315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3516  inner-membrane translocator  37 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3327  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3988  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  37.18 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3373  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  37.18 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0196  putative branched-chain amino acid ABC transporter integral membrane subunit  37.18 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.47626  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2997  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  37.18 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1605  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  37.18 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4062  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  37.18 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  42.16 
 
 		 840 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 343 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  39.51 
 
 		 597 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  39.78 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 652 aa  152  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3518  inner-membrane translocator  41.78 
 
 		 332 aa  152  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.507962 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0105  inner-membrane translocator  38.32 
 
 		 325 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2968  inner-membrane translocator  38.32 
 
 		 325 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0087  inner-membrane translocator  38.32 
 
 		 325 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410791  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1285  inner-membrane translocator  38 
 
 		 326 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  35.14 
 
 		 625 aa  151  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  36.55 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  40.36 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1713  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0542902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0087  inner-membrane translocator  37.96 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>