More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3323 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I3323  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 397 aa  766    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3985  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  97.15 
 
 		 351 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2941  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  97.44 
 
 		 351 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3000  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  97.44 
 
 		 351 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.403467  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0193  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  97.44 
 
 		 351 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3370  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  97.44 
 
 		 351 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1602  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  97.44 
 
 		 351 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4059  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  97.15 
 
 		 351 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0091  inner-membrane translocator  87.14 
 
 		 351 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0081  inner-membrane translocator  87.43 
 
 		 351 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0090  inner-membrane translocator  86.86 
 
 		 351 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3272  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  85.71 
 
 		 351 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0090  inner-membrane translocator  81.41 
 
 		 394 aa  557  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823802  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0107  inner-membrane translocator  86.57 
 
 		 351 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2965  inner-membrane translocator  81.41 
 
 		 394 aa  557  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235343  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0025  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  81.43 
 
 		 351 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.746489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3042  inner-membrane translocator  79.43 
 
 		 351 aa  541  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3908  inner-membrane translocator  80 
 
 		 351 aa  541  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3363  inner-membrane translocator  70.86 
 
 		 350 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3512  inner-membrane translocator  71.14 
 
 		 350 aa  448  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0408964 
 
 
-
 
NC_003296  RS01744  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  68.86 
 
 		 350 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.698868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4526  inner-membrane translocator  68.86 
 
 		 350 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.141329  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4658  inner-membrane translocator  68.86 
 
 		 350 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.14788 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3236  inner-membrane translocator  58.45 
 
 		 349 aa  398  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0230482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0268  inner-membrane translocator  57.71 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1518  inner-membrane translocator  63.43 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  59.71 
 
 		 951 aa  364  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0801  inner-membrane translocator  55.71 
 
 		 346 aa  361  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2942  inner-membrane translocator  62.29 
 
 		 345 aa  360  3e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1821  inner-membrane translocator  52.29 
 
 		 345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.683409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0990  inner-membrane translocator  60.57 
 
 		 345 aa  355  8.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  60 
 
 		 950 aa  349  4e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1229  inner-membrane translocator  55.43 
 
 		 342 aa  335  7e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1995  inner-membrane translocator  55.56 
 
 		 346 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5328  inner-membrane translocator  56.29 
 
 		 345 aa  324  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0654205  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3952  inner-membrane translocator  52.63 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3571  inner-membrane translocator  55.14 
 
 		 346 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0573  inner-membrane translocator  56.57 
 
 		 342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7085  ABC transporter, permease protein  54.68 
 
 		 341 aa  315  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0693  inner-membrane translocator  50 
 
 		 349 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1892  inner-membrane translocator  54.86 
 
 		 346 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.322186  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4633  inner-membrane translocator  51.41 
 
 		 345 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0776  inner-membrane translocator  52.29 
 
 		 345 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.300879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3249  branched chain amino acid ABC transporter permease  48.71 
 
 		 347 aa  292  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174248  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  47.43 
 
 		 954 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2424  inner-membrane translocator  57.71 
 
 		 349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.69608  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0996  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  44.57 
 
 		 357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.883581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2875  inner-membrane translocator  46.72 
 
 		 351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.781578  normal  0.470002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1505  inner-membrane translocator  49.12 
 
 		 351 aa  250  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122982  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1327  inner-membrane translocator  42.62 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.492198  normal  0.0368007 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2317  inner-membrane translocator  44.29 
 
 		 343 aa  229  9e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  39.92 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  32.83 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  37.14 
 
 		 293 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 295 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  38.14 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  31.22 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  32.9 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0679  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 294 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0669  inner-membrane translocator  39 
 
 		 294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 294 aa  110  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  30.97 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4550  inner-membrane translocator  40.29 
 
 		 290 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  35.98 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  31.55 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.06 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3821  inner-membrane translocator  38.15 
 
 		 293 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  30.96 
 
 		 300 aa  98.6  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0385  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 293 aa  96.3  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1680  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1408  inner-membrane translocator  33.5 
 
 		 317 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  27.38 
 
 		 292 aa  93.2  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 287 aa  92.8  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 295 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 287 aa  91.3  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 291 aa  89.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0290  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 306 aa  87.8  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  27.6 
 
 		 290 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  28.27 
 
 		 603 aa  86.3  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.77 
 
 		 294 aa  85.9  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  28.06 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  28.19 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.95 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  27.68 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  35.78 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  27.48 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  26.91 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.48 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.48 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  36.41 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.11 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  27.68 
 
 		 603 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  27.84 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  27.68 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>