More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1821 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1821  inner-membrane translocator  100 
 
 
345 aa  684    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.683409  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1518  inner-membrane translocator  60.87 
 
 
345 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2942  inner-membrane translocator  60.29 
 
 
345 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  56.94 
 
 
951 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  57.18 
 
 
950 aa  363  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3042  inner-membrane translocator  51.43 
 
 
351 aa  352  7e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0025  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  51.43 
 
 
351 aa  352  7e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.746489  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3236  inner-membrane translocator  52.15 
 
 
349 aa  349  5e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0230482  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3908  inner-membrane translocator  50.86 
 
 
351 aa  349  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01744  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  52.57 
 
 
350 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.698868  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3363  inner-membrane translocator  53.14 
 
 
350 aa  346  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3512  inner-membrane translocator  53.54 
 
 
350 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0408964 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3323  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  52.71 
 
 
397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0090  inner-membrane translocator  50.57 
 
 
351 aa  343  4e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3272  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  50.29 
 
 
351 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0091  inner-membrane translocator  50.29 
 
 
351 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0081  inner-membrane translocator  50.29 
 
 
351 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3000  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  51.85 
 
 
351 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.403467  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3370  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  51.85 
 
 
351 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2941  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  51.85 
 
 
351 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0193  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  51.85 
 
 
351 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107939  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1602  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  51.85 
 
 
351 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3985  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  52.14 
 
 
351 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4059  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  51.85 
 
 
351 aa  338  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0268  inner-membrane translocator  50.43 
 
 
345 aa  333  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0801  inner-membrane translocator  52.6 
 
 
346 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4658  inner-membrane translocator  53.14 
 
 
350 aa  329  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.14788 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4526  inner-membrane translocator  53.14 
 
 
350 aa  329  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.141329  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0990  inner-membrane translocator  51.01 
 
 
345 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2965  inner-membrane translocator  50.29 
 
 
394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235343  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0090  inner-membrane translocator  50.29 
 
 
394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823802  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0107  inner-membrane translocator  50.29 
 
 
351 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790851  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1229  inner-membrane translocator  53.03 
 
 
342 aa  327  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0573  inner-membrane translocator  52.75 
 
 
342 aa  315  9e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4403  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3952  inner-membrane translocator  49.72 
 
 
360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1995  inner-membrane translocator  48.41 
 
 
346 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0693  inner-membrane translocator  47.13 
 
 
349 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  45.8 
 
 
954 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3571  inner-membrane translocator  46.96 
 
 
346 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5328  inner-membrane translocator  48.84 
 
 
345 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0654205  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0776  inner-membrane translocator  46.53 
 
 
345 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.300879  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7085  ABC transporter, permease protein  49.41 
 
 
341 aa  282  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3249  branched chain amino acid ABC transporter permease  43.6 
 
 
347 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174248  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4633  inner-membrane translocator  46.42 
 
 
345 aa  279  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1892  inner-membrane translocator  47.83 
 
 
346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.322186  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2424  inner-membrane translocator  53.03 
 
 
349 aa  271  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.69608  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0996  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.69 
 
 
357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.883581  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2875  inner-membrane translocator  44.7 
 
 
351 aa  252  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.781578  normal  0.470002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1505  inner-membrane translocator  45.06 
 
 
351 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122982  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1327  inner-membrane translocator  40.68 
 
 
343 aa  233  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.492198  normal  0.0368007 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2317  inner-membrane translocator  40.96 
 
 
343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  30.79 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  35.05 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0669  inner-membrane translocator  30.15 
 
 
294 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  35.24 
 
 
291 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  31.94 
 
 
293 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  27.98 
 
 
294 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  33.5 
 
 
290 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3821  inner-membrane translocator  38.69 
 
 
293 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0290  inner-membrane translocator  31.68 
 
 
306 aa  99.8  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  27.65 
 
 
294 aa  99.8  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1680  inner-membrane translocator  28.31 
 
 
291 aa  99.8  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  31.88 
 
 
294 aa  99.4  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  27.33 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4550  inner-membrane translocator  35.71 
 
 
290 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  27.69 
 
 
295 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.4 
 
 
294 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  33.02 
 
 
291 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  29.31 
 
 
294 aa  94.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  34.47 
 
 
300 aa  94  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  29.94 
 
 
291 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  32.21 
 
 
294 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  28.4 
 
 
291 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0679  inner-membrane translocator  32.58 
 
 
290 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6015  inner-membrane translocator  29.03 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00174131 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  28.93 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  27.7 
 
 
290 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  32.52 
 
 
294 aa  87  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  30.04 
 
 
289 aa  86.7  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1408  inner-membrane translocator  30.1 
 
 
317 aa  86.7  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0385  inner-membrane translocator  32.58 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  31.46 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  30.23 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  26.24 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  32.85 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  31.05 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  30.08 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  28.06 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1136  inner-membrane translocator  29.96 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0602243  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  23.63 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  32.54 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  26.61 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  30.67 
 
 
603 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2031  inner-membrane translocator  28 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.24 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.24 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  26.88 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  32.85 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  26.03 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  26.82 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>