More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2875 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2875  inner-membrane translocator  100 
 
 		 351 aa  661    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.781578  normal  0.470002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1505  inner-membrane translocator  85.5 
 
 		 351 aa  478  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3249  branched chain amino acid ABC transporter permease  58.91 
 
 		 347 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174248  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0081  inner-membrane translocator  49.72 
 
 		 351 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0091  inner-membrane translocator  49.43 
 
 		 351 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0090  inner-membrane translocator  49.15 
 
 		 351 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3272  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  49.15 
 
 		 351 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0025  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  48.3 
 
 		 351 aa  292  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.746489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3908  inner-membrane translocator  48.01 
 
 		 351 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3236  inner-membrane translocator  47.14 
 
 		 349 aa  290  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0230482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0107  inner-membrane translocator  49.72 
 
 		 351 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3042  inner-membrane translocator  46.02 
 
 		 351 aa  285  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3363  inner-membrane translocator  48.15 
 
 		 350 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102738  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2965  inner-membrane translocator  49.43 
 
 		 394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235343  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0090  inner-membrane translocator  49.43 
 
 		 394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823802  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01744  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  50.43 
 
 		 350 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.698868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  49.42 
 
 		 951 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1518  inner-membrane translocator  50 
 
 		 345 aa  279  5e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  49.85 
 
 		 950 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3512  inner-membrane translocator  49.14 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0408964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0801  inner-membrane translocator  47.58 
 
 		 346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0268  inner-membrane translocator  47.11 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3952  inner-membrane translocator  49.18 
 
 		 360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4059  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  47.71 
 
 		 351 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1821  inner-membrane translocator  45.04 
 
 		 345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.683409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0990  inner-membrane translocator  47.14 
 
 		 345 aa  272  7e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4526  inner-membrane translocator  50.71 
 
 		 350 aa  271  9e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.141329  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4658  inner-membrane translocator  50.71 
 
 		 350 aa  271  9e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.14788 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1602  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  47.71 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2941  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.71 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0193  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.71 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3000  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  47.71 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.403467  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3370  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  47.71 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3323  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.43 
 
 		 397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3985  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  47.71 
 
 		 351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2942  inner-membrane translocator  50 
 
 		 345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1229  inner-membrane translocator  47.34 
 
 		 342 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0573  inner-membrane translocator  51.3 
 
 		 342 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3571  inner-membrane translocator  47.43 
 
 		 346 aa  255  8e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7085  ABC transporter, permease protein  47.4 
 
 		 341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0693  inner-membrane translocator  43.18 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1995  inner-membrane translocator  46.99 
 
 		 346 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4633  inner-membrane translocator  46.24 
 
 		 345 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0776  inner-membrane translocator  47.69 
 
 		 345 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.300879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  42.53 
 
 		 954 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5328  inner-membrane translocator  46.11 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0654205  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1892  inner-membrane translocator  45.69 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.322186  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2424  inner-membrane translocator  50 
 
 		 349 aa  232  9e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.69608  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0996  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  41.19 
 
 		 357 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.883581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1327  inner-membrane translocator  43.14 
 
 		 343 aa  216  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.492198  normal  0.0368007 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2317  inner-membrane translocator  43.38 
 
 		 343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0669  inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 293 aa  95.9  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  27.83 
 
 		 319 aa  95.9  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  28.32 
 
 		 291 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  34.85 
 
 		 287 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  27.63 
 
 		 291 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 311 aa  89.7  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4866  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  hitchhiker  0.000815383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4744  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  hitchhiker  0.000000155208 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  32.71 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1136  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 286 aa  88.6  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0602243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4922  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 304 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.75867  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  31.84 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 291 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  32.6 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1791  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 294 aa  87.8  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  42.5 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 300 aa  87.4  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4658  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 304 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026431 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  33.19 
 
 		 287 aa  86.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64890  putative permease of ABC branched chain amino acid transporter  33.17 
 
 		 304 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 294 aa  86.3  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1680  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 291 aa  86.3  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4918  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein BraD  32.68 
 
 		 304 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0553  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 304 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0455233  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.6 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0598  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34105  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  30.67 
 
 		 291 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  34.57 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 302 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1112  inner-membrane translocator  30.67 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0290  inner-membrane translocator  32.64 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  31.9 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3821  inner-membrane translocator  37.16 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2031  inner-membrane translocator  27.88 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2249  inner-membrane translocator  34.05 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.749308 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4550  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  33.98 
 
 		 287 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6015  inner-membrane translocator  27.08 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00174131 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  32.61 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  30.66 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  32.61 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>