More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4118 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4118  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  56.67 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  58.33 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  55 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  39.45 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  55 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  35.58 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4277  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  36.89 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  36.05 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  52.11 
 
 		 209 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 275 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 275 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.61 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.61 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3451  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 278 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 278 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 278 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 72 aa  48.9  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.5 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  50 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  32.89 
 
 		 241 aa  48.1  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3054  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 126 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108952 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 277 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1038  regulatory protein, TetR  43.48 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0256263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  26.04 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 291 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  31.51 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 283 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>