133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3183 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  100 
 
 		 717 aa  1450    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3168  exporter of the RND superfamily protein-like protein  39.32 
 
 		 723 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210013  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  25.39 
 
 		 764 aa  211  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  23.61 
 
 		 792 aa  206  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  24.9 
 
 		 779 aa  203  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  25.36 
 
 		 800 aa  203  7e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  23.36 
 
 		 811 aa  181  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  22.43 
 
 		 765 aa  157  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  22.66 
 
 		 778 aa  136  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  23.82 
 
 		 755 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  23.98 
 
 		 807 aa  117  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  24.23 
 
 		 756 aa  115  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  22.48 
 
 		 828 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  22.68 
 
 		 905 aa  106  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  21.82 
 
 		 825 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  22.55 
 
 		 835 aa  105  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  21.01 
 
 		 816 aa  102  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.26 
 
 		 967 aa  91.3  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  24.13 
 
 		 821 aa  90.9  7e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  20.94 
 
 		 872 aa  89.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.65 
 
 		 773 aa  88.2  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  21.57 
 
 		 806 aa  88.2  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  19.31 
 
 		 815 aa  87.4  8e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.73 
 
 		 807 aa  87.4  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  21.09 
 
 		 821 aa  87.4  9e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  20.78 
 
 		 815 aa  85.9  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  20.38 
 
 		 808 aa  84  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  20.76 
 
 		 824 aa  84  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  21.28 
 
 		 788 aa  80.9  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.87 
 
 		 837 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  19.64 
 
 		 813 aa  77.8  0.0000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  22.12 
 
 		 801 aa  77.4  0.0000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  25.46 
 
 		 860 aa  76.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  20.25 
 
 		 831 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.36 
 
 		 764 aa  75.5  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  21.38 
 
 		 881 aa  72.8  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.5 
 
 		 756 aa  73.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  23.12 
 
 		 763 aa  70.9  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  20.58 
 
 		 752 aa  69.3  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.37 
 
 		 746 aa  67.4  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  20.67 
 
 		 823 aa  67.4  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  20.8 
 
 		 823 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  24.48 
 
 		 751 aa  64.3  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  19.8 
 
 		 755 aa  64.3  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  20.63 
 
 		 823 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  22.4 
 
 		 779 aa  63.9  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  29.41 
 
 		 865 aa  63.2  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  20.93 
 
 		 796 aa  63.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  20.95 
 
 		 789 aa  62.4  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  19.4 
 
 		 789 aa  61.6  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  20.16 
 
 		 1359 aa  61.2  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  20.52 
 
 		 777 aa  61.2  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  19.3 
 
 		 804 aa  61.2  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  18.82 
 
 		 748 aa  60.8  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  21.88 
 
 		 1051 aa  60.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  29.06 
 
 		 1204 aa  59.7  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  24.64 
 
 		 1131 aa  58.9  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.96 
 
 		 762 aa  58.9  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  22.33 
 
 		 747 aa  58.2  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  22.13 
 
 		 788 aa  58.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2562  RND efflux transporter  19.66 
 
 		 697 aa  57.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  18.87 
 
 		 727 aa  57.4  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.98 
 
 		 1109 aa  57  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  20.76 
 
 		 778 aa  57  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  20.41 
 
 		 689 aa  57  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  18.98 
 
 		 803 aa  56.6  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  19.92 
 
 		 797 aa  56.6  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  19.82 
 
 		 830 aa  55.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  22.37 
 
 		 877 aa  55.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  18.94 
 
 		 1083 aa  55.1  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  25.75 
 
 		 895 aa  54.3  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  25.56 
 
 		 1225 aa  54.3  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.3 
 
 		 798 aa  54.3  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  23.35 
 
 		 812 aa  53.5  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  21.52 
 
 		 753 aa  53.5  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  22.87 
 
 		 861 aa  53.5  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  22.98 
 
 		 674 aa  53.5  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  19.33 
 
 		 898 aa  52.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  29.2 
 
 		 901 aa  52.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  26.86 
 
 		 800 aa  52.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  21.49 
 
 		 788 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  24.13 
 
 		 874 aa  52  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  21.57 
 
 		 674 aa  52  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  23.98 
 
 		 1011 aa  52  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.93 
 
 		 1172 aa  51.6  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  21.01 
 
 		 808 aa  51.2  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  19.52 
 
 		 380 aa  51.2  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  22.03 
 
 		 768 aa  50.8  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0221  RND efflux transporter  25.58 
 
 		 771 aa  50.4  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.822518  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  24.72 
 
 		 770 aa  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  19.92 
 
 		 805 aa  49.7  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  19.92 
 
 		 806 aa  49.3  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  19.09 
 
 		 385 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  20.22 
 
 		 767 aa  49.7  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  21.49 
 
 		 786 aa  48.9  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  23.96 
 
 		 859 aa  48.9  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  20.38 
 
 		 805 aa  48.9  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  20.38 
 
 		 805 aa  48.9  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  24.86 
 
 		 1002 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  21.07 
 
 		 388 aa  49.3  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>