194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7053 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 404 aa  792    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  80.35 
 
 		 425 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  63.61 
 
 		 393 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  60.8 
 
 		 420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  62.1 
 
 		 373 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  58.84 
 
 		 384 aa  381  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  54.25 
 
 		 408 aa  365  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  55.01 
 
 		 421 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  52.53 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 403 aa  358  7e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  53.58 
 
 		 392 aa  346  5e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  49.49 
 
 		 414 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  53.21 
 
 		 419 aa  342  7e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  54.35 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  50.13 
 
 		 386 aa  332  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  48.89 
 
 		 426 aa  329  5.0000000000000004e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  52.12 
 
 		 394 aa  315  7e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  52.23 
 
 		 408 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  51.97 
 
 		 473 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  45.11 
 
 		 539 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  50.89 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  49.22 
 
 		 413 aa  298  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  44.39 
 
 		 400 aa  290  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  47.92 
 
 		 393 aa  286  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  49.74 
 
 		 429 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  45.74 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  42.45 
 
 		 418 aa  262  6e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  42.75 
 
 		 429 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  42.93 
 
 		 428 aa  247  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  43.38 
 
 		 428 aa  245  8e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  43.31 
 
 		 428 aa  242  9e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  43.31 
 
 		 428 aa  242  9e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  42.53 
 
 		 414 aa  241  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  43.04 
 
 		 428 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  43.36 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  28.03 
 
 		 453 aa  93.6  6e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  38 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  32.27 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  34.53 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  32.35 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  39.64 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  33.94 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  33.03 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  44.93 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  30.88 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  36.89 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  46.97 
 
 		 478 aa  57  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  32.11 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  32.11 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  24.19 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  32.32 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  32.32 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  28.25 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  30.28 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  32.81 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  54.72 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  46.88 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2653  hypothetical protein  21.95 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2339  hypothetical protein  21.95 
 
 		 313 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 563 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  42.86 
 
 		 442 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 526 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  46.15 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  28.21 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  31.46 
 
 		 400 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  41.67 
 
 		 454 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  55.56 
 
 		 365 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  32.56 
 
 		 414 aa  49.7  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4926  transcriptional regulator, CdaR  42.86 
 
 		 395 aa  49.7  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 486 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  42.37 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  55.81 
 
 		 514 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 429 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2197  transcriptional regulator, PucR family  36.36 
 
 		 540 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 429 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.67 
 
 		 459 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 429 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4050  putative carbohydrate diacid regulator  37.7 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  43.1 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6541  hypothetical protein  24.31 
 
 		 246 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3281  carbohydrate diacid regulator, putative  42.86 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 564 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4866  CdaR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  38.1 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 659 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  34.62 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1045  transcriptional regulator, CdaR  22.57 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204704  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0113  transcriptional regulator, CdaR  38.6 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3116  putative sugar diacid recognition  42.86 
 
 		 363 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  41.94 
 
 		 600 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.84 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  28.36 
 
 		 520 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4083  putative carbohydrate diacid regulator  37.7 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.329455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  48.78 
 
 		 407 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  37.65 
 
 		 554 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>