186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4538 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 243 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  69.63 
 
 		 232 aa  268  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  57.69 
 
 		 222 aa  242  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  51.97 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  44.03 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 217 aa  118  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 221 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 218 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  35.6 
 
 		 197 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 208 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  37.07 
 
 		 206 aa  99  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  42.77 
 
 		 221 aa  99  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  36.46 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 206 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 193 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  36.78 
 
 		 196 aa  92  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 212 aa  91.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 195 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 195 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 195 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  24.9 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 167 aa  57  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 196 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  23.56 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  22.89 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  21.72 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 174 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 333 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  28.12 
 
 		 205 aa  52.8  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  31.18 
 
 		 206 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 204 aa  52.4  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 195 aa  52  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  25.9 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0387  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 174 aa  50.4  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 240 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 283 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 207 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 205 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 197 aa  48.9  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>