268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2697 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2697  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 355 aa  707    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0766  lytic transglycosylase, catalytic  78.33 
 
 		 354 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.892374  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0658  Lytic transglycosylase catalytic  56.34 
 
 		 395 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.118125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0702  Lytic transglycosylase catalytic  56.69 
 
 		 394 aa  299  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.417607  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0709  hypothetical protein  60.78 
 
 		 362 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3021  Slt family transglycosylase  52.9 
 
 		 370 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734248  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2021  Slt family transglycosylase  68.79 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0759  Slt family transglycosylase  68.79 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.404866  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2592  Slt family transglycosylase  68.79 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2149  transglycosylase SLT domain-containing protein  51.81 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3105  transglycosylase SLT domain-containing protein  51.81 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3074  Slt family transglycosylase  51.81 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1527  transglycosylase SLT domain-containing protein  69.64 
 
 		 367 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165503  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3105  Lytic transglycosylase catalytic  68.86 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0889  transglycosylase SLT domain-containing lipoprotein  61.42 
 
 		 398 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0615  lytic transglycosylase catalytic  66.27 
 
 		 404 aa  235  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  64.88 
 
 		 378 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  64.88 
 
 		 378 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  64.88 
 
 		 378 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  46.94 
 
 		 370 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  64.88 
 
 		 372 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  64.88 
 
 		 372 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  63.69 
 
 		 374 aa  222  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  57.69 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  58.72 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4954  lytic transglycosylase catalytic  58.43 
 
 		 303 aa  186  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2906  lytic transglycosylase, catalytic  54.91 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0327296  normal  0.0416217 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1661  lytic transglycosylase, catalytic  63.12 
 
 		 279 aa  180  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2043  Lytic transglycosylase catalytic  63.12 
 
 		 279 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.944666  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2991  lytic transglycosylase, catalytic  59.57 
 
 		 295 aa  175  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2873  lytic transglycosylase, catalytic  58.33 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113557  normal  0.33639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3099  Lytic transglycosylase catalytic  57.86 
 
 		 272 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  58.87 
 
 		 252 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2657  lytic transglycosylase, catalytic  56.03 
 
 		 267 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00887082  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0364  lytic transglycosylase, catalytic  47.4 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0365  Lytic transglycosylase catalytic  46.24 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3533  lytic transglycosylase, catalytic  43.26 
 
 		 226 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 304 aa  106  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  28.75 
 
 		 228 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  30.22 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  30.22 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  30.83 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  28.85 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  34.11 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  32.56 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  33.04 
 
 		 223 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  40.7 
 
 		 242 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2468  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5063  lytic transglycosylase catalytic  29.5 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  29.25 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  33.06 
 
 		 782 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  38.26 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  40.66 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  32.74 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  49.02 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  33.6 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  38.54 
 
 		 833 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  40 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  29.25 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  39.58 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  39.36 
 
 		 198 aa  57  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  31.4 
 
 		 777 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  29.59 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0744  lytic transglycosylase, catalytic  27.93 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0220327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  30.77 
 
 		 223 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0177  Lytic transglycosylase catalytic  26.89 
 
 		 239 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000012846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  40 
 
 		 196 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 280 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 253 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  40.51 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  28.57 
 
 		 179 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  29.08 
 
 		 206 aa  54.3  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  40.22 
 
 		 282 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  29.59 
 
 		 226 aa  54.3  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1794  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 152 aa  53.9  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  29.31 
 
 		 227 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2563  Lytic transglycosylase catalytic  32.28 
 
 		 228 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0148918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1297  lytic transglycosylase, catalytic  37.63 
 
 		 228 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  35.05 
 
 		 800 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2659  Lytic transglycosylase catalytic  37.63 
 
 		 228 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.725375  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  29.13 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  44.93 
 
 		 204 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  35.14 
 
 		 678 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  32.71 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  34.09 
 
 		 798 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  40.85 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0195  lytic transglycosylase catalytic protein  25.21 
 
 		 239 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  38.46 
 
 		 639 aa  50.8  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  28.57 
 
 		 219 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  38.46 
 
 		 639 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  28.45 
 
 		 217 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0477  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  42.67 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0327755  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  38.46 
 
 		 639 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0088  Lytic transglycosylase catalytic  36.04 
 
 		 262 aa  51.2  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0163  lytic transglycosylase, catalytic  33.93 
 
 		 145 aa  50.4  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0042056  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  34.18 
 
 		 661 aa  50.4  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0399  Lytic transglycosylase catalytic  32.19 
 
 		 574 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  27.43 
 
 		 218 aa  50.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.808062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>