96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1747 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  100 
 
 		 574 aa  1151    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  54.21 
 
 		 577 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  46.25 
 
 		 562 aa  449  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  43.68 
 
 		 573 aa  422  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  37.41 
 
 		 569 aa  312  9e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  37.11 
 
 		 556 aa  293  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  36.36 
 
 		 600 aa  286  9e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  34.9 
 
 		 649 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  35.11 
 
 		 604 aa  272  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  32.32 
 
 		 593 aa  263  4.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  34.01 
 
 		 593 aa  249  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.07 
 
 		 574 aa  246  6e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.73 
 
 		 546 aa  243  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.35 
 
 		 551 aa  243  9e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  33.93 
 
 		 583 aa  233  5e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.39 
 
 		 596 aa  207  5e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  32.55 
 
 		 604 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.74 
 
 		 585 aa  201  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  30.34 
 
 		 1120 aa  171  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.63 
 
 		 1193 aa  151  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  30.43 
 
 		 1098 aa  148  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  28.05 
 
 		 1208 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  32.9 
 
 		 803 aa  146  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  26.32 
 
 		 1183 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.25 
 
 		 1228 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.95 
 
 		 1226 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  26.82 
 
 		 1107 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.24 
 
 		 1189 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  25.91 
 
 		 1088 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.47 
 
 		 1246 aa  138  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.22 
 
 		 1208 aa  137  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  27.07 
 
 		 1127 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.22 
 
 		 1192 aa  133  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.21 
 
 		 1236 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  26.03 
 
 		 1109 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.45 
 
 		 1225 aa  127  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.05 
 
 		 737 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  25.54 
 
 		 1129 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  25.5 
 
 		 1113 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  25.66 
 
 		 1166 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.56 
 
 		 1066 aa  117  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  26.93 
 
 		 585 aa  114  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1575 aa  114  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  29.29 
 
 		 951 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  37.08 
 
 		 1170 aa  108  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  25.05 
 
 		 1127 aa  103  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  24.92 
 
 		 1161 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  30.82 
 
 		 1126 aa  97.8  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  31.98 
 
 		 1098 aa  94  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.28 
 
 		 1114 aa  93.6  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  26.59 
 
 		 554 aa  91.3  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  29.97 
 
 		 1203 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  27.5 
 
 		 1172 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.84 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  24.56 
 
 		 878 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  26.3 
 
 		 1184 aa  80.5  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  25.5 
 
 		 691 aa  79  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.51 
 
 		 455 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.52 
 
 		 526 aa  71.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  25.72 
 
 		 521 aa  71.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  29.43 
 
 		 499 aa  67.8  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  24.94 
 
 		 1838 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  26.84 
 
 		 1490 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  27.64 
 
 		 1126 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1289 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  31.69 
 
 		 566 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  26.01 
 
 		 566 aa  60.8  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  22.84 
 
 		 658 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.85 
 
 		 2807 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  30.05 
 
 		 1133 aa  57.4  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  29.79 
 
 		 664 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.53 
 
 		 1040 aa  55.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  21.19 
 
 		 655 aa  54.7  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  27.97 
 
 		 646 aa  53.5  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  26.39 
 
 		 1275 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  33.58 
 
 		 492 aa  52.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.64 
 
 		 645 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.81 
 
 		 11716 aa  52  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.48 
 
 		 657 aa  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  27.16 
 
 		 469 aa  51.6  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  30.74 
 
 		 604 aa  51.6  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  30.13 
 
 		 730 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  23.92 
 
 		 668 aa  50.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  21.85 
 
 		 638 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  26.4 
 
 		 616 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  24.87 
 
 		 681 aa  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.22 
 
 		 573 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  23.29 
 
 		 685 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  23.29 
 
 		 685 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  30.06 
 
 		 472 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  28.16 
 
 		 645 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  27.39 
 
 		 974 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  42.65 
 
 		 8871 aa  44.7  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6354  FG-GAP repeat protein  38.04 
 
 		 423 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.505611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  30.5 
 
 		 524 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  24.35 
 
 		 437 aa  43.5  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>