73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2157 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  100 
 
 		 207 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5703  putative transcriptional regulator  39.78 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  38.83 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  36.27 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3980  putative transcriptional regulator  35.44 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00414076  normal  0.398554 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  37.62 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 		 241 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1587  putative transcriptional regulator  30.59 
 
 		 225 aa  95.5  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 		 230 aa  95.5  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1398  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 		 160 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  35.4 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  35.38 
 
 		 620 aa  75.1  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  32.8 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 469 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  31.2 
 
 		 412 aa  72  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  38.2 
 
 		 386 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  35.24 
 
 		 402 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  37.39 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  32.38 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 480 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 480 aa  62  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  40.28 
 
 		 471 aa  61.6  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  32.04 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  35 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  40.58 
 
 		 448 aa  55.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  29.55 
 
 		 494 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1081  putative transcriptional regulator  37.68 
 
 		 492 aa  53.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  31.4 
 
 		 469 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 		 484 aa  53.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  40.54 
 
 		 448 aa  53.1  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  24.27 
 
 		 485 aa  51.6  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0617  ATPase central domain-containing protein  35.2 
 
 		 377 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  35.42 
 
 		 430 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  31.9 
 
 		 382 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  32.56 
 
 		 545 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  29.63 
 
 		 548 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0631  ATPase central domain-containing protein  32.8 
 
 		 377 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  24.2 
 
 		 433 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  32.73 
 
 		 374 aa  49.7  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  30.56 
 
 		 483 aa  49.7  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  28.71 
 
 		 545 aa  49.3  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  29.29 
 
 		 555 aa  49.3  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0557  putative transcriptional regulator  26.58 
 
 		 360 aa  49.3  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 499 aa  48.9  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  26.14 
 
 		 561 aa  48.9  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 467 aa  48.1  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  30.39 
 
 		 468 aa  48.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0553  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 489 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  26.72 
 
 		 458 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  28 
 
 		 462 aa  47.4  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2947  hypothetical protein  31.1 
 
 		 356 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000155126  hitchhiker  0.00244258 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 412 aa  46.6  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  25.74 
 
 		 485 aa  45.4  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  26.83 
 
 		 389 aa  45.1  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0344  AAA-4 family protein  28.43 
 
 		 199 aa  45.1  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  26.26 
 
 		 556 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  26 
 
 		 467 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 		 477 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5330  putative transcriptional regulator  31.71 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6893  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.195697  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  26.61 
 
 		 456 aa  43.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3019  putative transcriptional regulator  44 
 
 		 65 aa  42.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  24.37 
 
 		 586 aa  42.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  34.38 
 
 		 705 aa  42.4  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 551 aa  42  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1143  hypothetical protein  34.57 
 
 		 277 aa  41.6  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.046118  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 456 aa  41.6  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1712  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 138 aa  41.6  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>