246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_87197 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_87197  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  100 
 
 
490 aa  971    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35587  hypothetical protein  40.09 
 
 
561 aa  292  8e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.713211  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  30.49 
 
 
560 aa  141  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  25.22 
 
 
453 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  27.8 
 
 
492 aa  92.8  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  27 
 
 
434 aa  89  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  27.39 
 
 
436 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  25.44 
 
 
451 aa  86.7  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  27.59 
 
 
466 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  25.85 
 
 
438 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  24.71 
 
 
445 aa  80.9  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  23 
 
 
453 aa  80.5  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  30.51 
 
 
427 aa  78.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.82 
 
 
464 aa  77.8  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  33.88 
 
 
462 aa  77.4  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.82 
 
 
464 aa  77.4  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  25.91 
 
 
449 aa  75.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.41 
 
 
461 aa  73.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  26.7 
 
 
442 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  29.86 
 
 
461 aa  72.8  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  29.39 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  25.76 
 
 
446 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  26.1 
 
 
450 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.79 
 
 
458 aa  69.7  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  25.22 
 
 
454 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28091  MOP(MATE) family transporter  30 
 
 
504 aa  68.6  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0057098  normal  0.084674 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  29.15 
 
 
454 aa  68.2  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  29.6 
 
 
500 aa  67.8  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  30 
 
 
463 aa  67.8  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  27.91 
 
 
477 aa  67  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  25.71 
 
 
448 aa  66.6  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  24.67 
 
 
496 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  26.98 
 
 
444 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  27.6 
 
 
459 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  26.98 
 
 
444 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  26.98 
 
 
444 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  26.3 
 
 
470 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  46.67 
 
 
453 aa  65.1  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44888  hypothetical protein  29.86 
 
 
555 aa  64.7  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  23.78 
 
 
453 aa  64.3  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.48 
 
 
485 aa  63.9  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  23.94 
 
 
443 aa  63.5  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  26.17 
 
 
456 aa  63.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  26.92 
 
 
442 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  26.17 
 
 
455 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  40.43 
 
 
476 aa  63.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  43.59 
 
 
451 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  27.02 
 
 
442 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  24.12 
 
 
456 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  24.12 
 
 
455 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  24.12 
 
 
455 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  27.88 
 
 
469 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  24.12 
 
 
455 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  28.23 
 
 
455 aa  62.4  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.39 
 
 
475 aa  62  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  26.67 
 
 
439 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  29.49 
 
 
454 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16054  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  27.67 
 
 
443 aa  61.2  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0679405  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  23.57 
 
 
440 aa  60.8  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  25.27 
 
 
503 aa  60.8  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  25.23 
 
 
461 aa  60.5  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  25.53 
 
 
456 aa  60.5  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  28.57 
 
 
500 aa  60.1  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  25.68 
 
 
436 aa  60.1  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  25.62 
 
 
456 aa  60.1  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  25.81 
 
 
461 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  27.85 
 
 
455 aa  59.7  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  22.71 
 
 
456 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  40.24 
 
 
455 aa  58.9  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  24.26 
 
 
449 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  25.84 
 
 
454 aa  58.2  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3884  multi anti extrusion protein MatE  27.51 
 
 
469 aa  58.2  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.316697 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  25.7 
 
 
455 aa  57.4  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  27.27 
 
 
524 aa  57.8  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  28.43 
 
 
459 aa  57.4  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  24.31 
 
 
460 aa  57.4  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  28.08 
 
 
503 aa  57.4  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  24.19 
 
 
453 aa  57  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  26.38 
 
 
455 aa  57  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  27.88 
 
 
459 aa  56.6  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  29.1 
 
 
460 aa  56.6  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  31.91 
 
 
448 aa  56.6  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  29.1 
 
 
441 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  41.56 
 
 
459 aa  56.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  26.33 
 
 
453 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  22.71 
 
 
456 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  27.51 
 
 
458 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  28.26 
 
 
476 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.12 
 
 
468 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  26.29 
 
 
454 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  37.36 
 
 
456 aa  56.6  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  29.91 
 
 
460 aa  56.6  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  25.65 
 
 
502 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  23.85 
 
 
445 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  46.67 
 
 
481 aa  55.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.13 
 
 
446 aa  55.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4001  MATE efflux family protein  24.77 
 
 
455 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.7 
 
 
486 aa  55.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  27.86 
 
 
442 aa  55.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  37.37 
 
 
460 aa  55.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>