More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_31014 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  100 
 
 
560 aa  1109    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  32.6 
 
 
492 aa  162  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  31.07 
 
 
453 aa  160  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87197  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  30.22 
 
 
490 aa  150  7e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  31.33 
 
 
449 aa  147  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  32.93 
 
 
451 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35587  hypothetical protein  28.69 
 
 
561 aa  138  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.713211  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  31.14 
 
 
448 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  30.66 
 
 
442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  29.31 
 
 
436 aa  130  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  30.68 
 
 
438 aa  127  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  29.95 
 
 
434 aa  127  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  28.79 
 
 
466 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  28.48 
 
 
445 aa  120  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  31.62 
 
 
446 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  29.91 
 
 
439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  30.48 
 
 
444 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  30.48 
 
 
444 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  30.48 
 
 
444 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  30.96 
 
 
442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  29.72 
 
 
465 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  29.23 
 
 
434 aa  111  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  29.04 
 
 
442 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  33.33 
 
 
470 aa  110  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  29.62 
 
 
434 aa  109  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  28.51 
 
 
441 aa  103  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  31.43 
 
 
427 aa  103  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  30.99 
 
 
450 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  29.3 
 
 
441 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.97 
 
 
458 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.16 
 
 
461 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  30.62 
 
 
460 aa  100  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  25 
 
 
449 aa  99.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  28.03 
 
 
453 aa  99  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  33.64 
 
 
470 aa  98.2  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  28.91 
 
 
455 aa  96.7  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  28.35 
 
 
442 aa  96.7  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  29.45 
 
 
442 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2155  MATE efflux family protein  28.23 
 
 
467 aa  93.2  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.430874  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12851  DNA-damage-inducible protein F dinF  28.38 
 
 
436 aa  89  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000020718  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  25.22 
 
 
443 aa  87.4  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  27.34 
 
 
459 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  23.99 
 
 
447 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55128  hypothetical protein  26.42 
 
 
449 aa  84  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0061  MATE efflux family protein  25.25 
 
 
448 aa  83.6  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.871817  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  24.78 
 
 
423 aa  83.6  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  24.78 
 
 
456 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2425  DNA-damage-inducible protein F  25.54 
 
 
454 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  23.88 
 
 
429 aa  82.8  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  26.37 
 
 
459 aa  82.8  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  23.91 
 
 
469 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.41 
 
 
470 aa  81.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  25.87 
 
 
445 aa  81.3  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  23.82 
 
 
438 aa  81.3  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  25 
 
 
436 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  25.91 
 
 
483 aa  80.9  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  26.15 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.25 
 
 
464 aa  80.1  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  25.27 
 
 
455 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  25.05 
 
 
456 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  25.27 
 
 
455 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  26.65 
 
 
445 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3501  DNA-damage-inducible protein F  24.68 
 
 
437 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  23.62 
 
 
467 aa  79  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25 
 
 
464 aa  79.3  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  27.02 
 
 
461 aa  78.6  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  30.79 
 
 
437 aa  78.6  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  23.57 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  24.84 
 
 
455 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  22.3 
 
 
453 aa  77.4  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  23.01 
 
 
469 aa  77.4  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  25.51 
 
 
446 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  24.41 
 
 
443 aa  77  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  25.85 
 
 
468 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44888  hypothetical protein  26.58 
 
 
555 aa  75.5  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.03 
 
 
475 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  30.16 
 
 
525 aa  75.5  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  26.39 
 
 
455 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  24.04 
 
 
469 aa  75.1  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.07 
 
 
475 aa  75.5  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  25.92 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  24.53 
 
 
447 aa  74.3  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  24.35 
 
 
444 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  25.06 
 
 
481 aa  73.6  0.000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  24.8 
 
 
446 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.74 
 
 
446 aa  72.4  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  26.64 
 
 
496 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  26.18 
 
 
454 aa  72.4  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  25.89 
 
 
456 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  26.53 
 
 
439 aa  71.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  25.57 
 
 
445 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  29.33 
 
 
486 aa  71.6  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  25.51 
 
 
445 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  23.23 
 
 
450 aa  70.9  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4001  MATE efflux family protein  25.59 
 
 
455 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  32.34 
 
 
481 aa  70.1  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  23.35 
 
 
502 aa  70.1  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1106  MATE efflux family protein  24.88 
 
 
472 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  22.74 
 
 
461 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  23.94 
 
 
467 aa  69.7  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>