More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1831 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  100 
 
 		 451 aa  858    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2253  MATE efflux family protein  62.9 
 
 		 434 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2591  multi anti extrusion protein MatE  51.35 
 
 		 493 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2619  multi antimicrobial extrusion protein MatE  50.66 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2814  multi antimicrobial extrusion protein MatE  50.56 
 
 		 493 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486087 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  47.27 
 
 		 483 aa  368  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3952  multi anti extrusion protein MatE  50.46 
 
 		 481 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.667584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6022  multi anti extrusion protein MatE  52.68 
 
 		 481 aa  363  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  0.0180252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7265  multi antimicrobial extrusion protein MatE  52.94 
 
 		 491 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  44.47 
 
 		 495 aa  353  4e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  45.81 
 
 		 520 aa  349  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  45.02 
 
 		 501 aa  349  5e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  45.23 
 
 		 515 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  42.82 
 
 		 505 aa  348  8e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  45.23 
 
 		 515 aa  348  8e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  45.35 
 
 		 520 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  45.23 
 
 		 515 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  45.23 
 
 		 515 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  45.35 
 
 		 517 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  43.31 
 
 		 503 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  43.28 
 
 		 521 aa  344  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  43.31 
 
 		 509 aa  342  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5118  multi anti extrusion protein MatE  47.32 
 
 		 453 aa  341  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  44.02 
 
 		 505 aa  329  8e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  42.89 
 
 		 516 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  44.44 
 
 		 531 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  44.68 
 
 		 486 aa  318  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  37.67 
 
 		 442 aa  316  7e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  43.74 
 
 		 465 aa  311  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  42.79 
 
 		 443 aa  306  7e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  41.86 
 
 		 459 aa  300  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  43.16 
 
 		 463 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0370  MATE efflux family protein  36.3 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3037  hypothetical protein  36.99 
 
 		 453 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0928609  normal  0.0798256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3172  hypothetical protein  37.14 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0893735  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2187  multi anti extrusion protein MatE  35.65 
 
 		 446 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.761127  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  27.66 
 
 		 454 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  29.67 
 
 		 462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 455 aa  120  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  27.53 
 
 		 451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  26.94 
 
 		 460 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  31.7 
 
 		 478 aa  114  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  25.47 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  25.06 
 
 		 456 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 454 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 455 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  32.33 
 
 		 467 aa  108  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  25.85 
 
 		 460 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 455 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 455 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  27.35 
 
 		 459 aa  106  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 456 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  25.21 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 468 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 439 aa  101  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  27.32 
 
 		 444 aa  99.8  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 460 aa  99.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  31.69 
 
 		 486 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  29.76 
 
 		 518 aa  97.4  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 477 aa  96.7  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  26.44 
 
 		 457 aa  95.1  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  33.45 
 
 		 485 aa  95.5  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  29.51 
 
 		 466 aa  94.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 442 aa  93.2  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  24.79 
 
 		 454 aa  92.8  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  25.08 
 
 		 454 aa  92.8  1e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 467 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 440 aa  90.1  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 451 aa  89.7  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  28.61 
 
 		 498 aa  89.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 500 aa  87.8  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.69 
 
 		 454 aa  86.7  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  23.3 
 
 		 448 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  27.42 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 456 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  24.13 
 
 		 456 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  26.25 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  25.14 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  23.58 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  22.41 
 
 		 462 aa  84.3  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  22.96 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  23.58 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 451 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  26.71 
 
 		 450 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>