More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3506 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  387  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  78.97 
 
 		 195 aa  295  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  63.19 
 
 		 191 aa  218  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  63.19 
 
 		 191 aa  218  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  61.41 
 
 		 189 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 185 aa  148  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 245 aa  94  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 287 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6347  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4255  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  30.68 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  54.39 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  28.87 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  29.89 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  29.19 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
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NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  27.92 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
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NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  28.72 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
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NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
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NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_3153  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.755786  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
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