More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2750 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  417  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  80.98 
 
 		 205 aa  338  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 201 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  54.08 
 
 		 200 aa  214  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 204 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 203 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  51.08 
 
 		 211 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 203 aa  193  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  47.85 
 
 		 196 aa  185  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  49.47 
 
 		 204 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  47.31 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  47.31 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  44.85 
 
 		 208 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  40.76 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  43.09 
 
 		 201 aa  146  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 206 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 195 aa  89  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 195 aa  88.6  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 205 aa  84.7  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  26.86 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  26.82 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6237  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.250294  normal  0.446462 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  30.94 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2160  TetR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  25.88 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  28.41 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  34.34 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1122  transcriptional regulator, TetR family  37.27 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0273535  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0612  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  23.03 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_1420  hypothetical protein  45.45 
 
 		 101 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57852  normal  0.215319 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
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NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal  1 
 
 
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NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
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NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 185 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 332 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007575  Suden_1439  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.187037  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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