183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3729 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2668  hypothetical protein  96.39 
 
 		 1743 aa  2986    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  100 
 
 		 1753 aa  3576    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1050  YD repeat-containing protein  36.58 
 
 		 1157 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1098  hypothetical protein  36.23 
 
 		 1172 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00467719  unclonable  0.0000000000319304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7099  YD repeat protein  32.09 
 
 		 1480 aa  333  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00495038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4641  YD repeat protein  31.64 
 
 		 1461 aa  330  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32679  hitchhiker  0.00117662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1395  YD repeat protein  31.55 
 
 		 1463 aa  313  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2123  YD repeat protein  31.17 
 
 		 1073 aa  280  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4142  hypothetical protein  29.58 
 
 		 1409 aa  278  7e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369154  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  26.14 
 
 		 2418 aa  209  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2076  YD repeat protein  27.83 
 
 		 1740 aa  205  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4225  hypothetical protein  35.44 
 
 		 809 aa  200  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4386  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1179 aa  192  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.241332  decreased coverage  0.00292232 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  40.82 
 
 		 3197 aa  141  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  24.24 
 
 		 2864 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  40.2 
 
 		 3197 aa  131  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  27.8 
 
 		 3794 aa  115  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3008  hypothetical protein  32.11 
 
 		 913 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3007  hypothetical protein  27.08 
 
 		 503 aa  98.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3613  hypothetical protein  85.42 
 
 		 254 aa  98.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.389609  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3207  RHS repeat-containing protein  28.44 
 
 		 2513 aa  91.3  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.127821 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  27.57 
 
 		 690 aa  84.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  32.02 
 
 		 628 aa  83.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3530  hypothetical protein  26.97 
 
 		 549 aa  83.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  26.54 
 
 		 2652 aa  82.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0606  YD repeat-containing protein  36.15 
 
 		 3662 aa  83.2  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  25.22 
 
 		 2443 aa  82  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_002978  WD0513  hypothetical protein  29.52 
 
 		 2843 aa  81.6  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  28.64 
 
 		 927 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  27.24 
 
 		 1976 aa  76.6  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  25.19 
 
 		 927 aa  75.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  26.88 
 
 		 1053 aa  73.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  29.24 
 
 		 1545 aa  71.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  25.44 
 
 		 2417 aa  70.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  27.66 
 
 		 2510 aa  71.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  30.41 
 
 		 1517 aa  70.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  22.18 
 
 		 2145 aa  69.7  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  26.11 
 
 		 3333 aa  68.9  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  26.81 
 
 		 1834 aa  67.8  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  25.4 
 
 		 788 aa  68.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  25.4 
 
 		 788 aa  68.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  22.86 
 
 		 3193 aa  68.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23.62 
 
 		 1917 aa  67.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  24.77 
 
 		 2374 aa  67.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  24.78 
 
 		 2458 aa  67  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.36 
 
 		 482 aa  67  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  23.39 
 
 		 1595 aa  66.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  23.39 
 
 		 1586 aa  65.9  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  24.04 
 
 		 1840 aa  65.9  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  22.45 
 
 		 1614 aa  65.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  26.47 
 
 		 2437 aa  64.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  25.06 
 
 		 1433 aa  64.7  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  27.08 
 
 		 955 aa  63.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  38.66 
 
 		 2554 aa  63.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  23.89 
 
 		 1935 aa  63.9  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  25.75 
 
 		 2401 aa  63.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  25.68 
 
 		 474 aa  63.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  25.15 
 
 		 1140 aa  63.5  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  26.16 
 
 		 2350 aa  63.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  22.87 
 
 		 1599 aa  62.8  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  23.53 
 
 		 3456 aa  62.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  23.12 
 
 		 1763 aa  61.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  23.46 
 
 		 1710 aa  60.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0948  insecticidal toxin protein, putative  28.78 
 
 		 942 aa  60.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  30 
 
 		 956 aa  60.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0947  insecticidal toxin protein, putative  29.49 
 
 		 893 aa  60.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.81125  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  26.39 
 
 		 741 aa  58.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  24 
 
 		 605 aa  58.9  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  29.18 
 
 		 886 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  28.49 
 
 		 2831 aa  58.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  26.5 
 
 		 1381 aa  58.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2167  YD repeat-containing protein  24.05 
 
 		 622 aa  58.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0177  hypothetical protein  36.96 
 
 		 232 aa  58.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  23.21 
 
 		 1689 aa  58.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  25.35 
 
 		 2017 aa  57.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.17 
 
 		 2094 aa  57.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.24 
 
 		 1600 aa  57.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  24.83 
 
 		 705 aa  57.4  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1143  YD repeat protein  26.76 
 
 		 1991 aa  57.4  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0172483 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  25.27 
 
 		 1427 aa  57  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  23.87 
 
 		 1147 aa  57.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0133  hypothetical protein  37.17 
 
 		 520 aa  57  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.800968  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  24.69 
 
 		 1577 aa  57  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  25.07 
 
 		 2283 aa  57  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  23.92 
 
 		 2448 aa  57  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  30.86 
 
 		 1464 aa  57  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  23.41 
 
 		 2762 aa  56.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  25.42 
 
 		 2479 aa  56.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  24.12 
 
 		 1723 aa  56.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  35.9 
 
 		 298 aa  55.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4266  hypothetical protein  35.9 
 
 		 298 aa  55.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23 
 
 		 1942 aa  55.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  32.35 
 
 		 2558 aa  55.5  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 2494 aa  55.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  27.67 
 
 		 940 aa  55.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  26.67 
 
 		 920 aa  55.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.21 
 
 		 903 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0036  YD repeat protein  24.3 
 
 		 1957 aa  55.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.13873 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  35.04 
 
 		 316 aa  54.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  44.44 
 
 		 1352 aa  54.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>