More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3120 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  100 
 
 		 461 aa  907    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  60.74 
 
 		 461 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  54.23 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  49.35 
 
 		 475 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  47.1 
 
 		 475 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  44.9 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  41.96 
 
 		 468 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  29.82 
 
 		 475 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  31.67 
 
 		 445 aa  209  9e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  30.56 
 
 		 486 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  30.97 
 
 		 454 aa  204  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  30.2 
 
 		 500 aa  202  8e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 448 aa  196  5.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  29.23 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 475 aa  190  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 460 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 468 aa  187  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 463 aa  186  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  30.16 
 
 		 481 aa  186  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  30.37 
 
 		 500 aa  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 462 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 485 aa  181  4e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 464 aa  179  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 538 aa  177  5e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  27.37 
 
 		 518 aa  176  8e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 499 aa  170  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  28.8 
 
 		 466 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.98 
 
 		 525 aa  168  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 453 aa  166  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  29.75 
 
 		 469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  27.92 
 
 		 452 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 467 aa  162  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  29.2 
 
 		 470 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.86 
 
 		 458 aa  160  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.41 
 
 		 463 aa  160  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 554 aa  160  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 458 aa  159  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  24.41 
 
 		 469 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 498 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26 
 
 		 500 aa  158  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  24.51 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  28.96 
 
 		 447 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  24.38 
 
 		 454 aa  154  2e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  24.07 
 
 		 469 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 447 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  24.51 
 
 		 469 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  24.29 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  28.26 
 
 		 485 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  23.85 
 
 		 469 aa  146  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  23.85 
 
 		 469 aa  146  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  23.85 
 
 		 469 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  24.13 
 
 		 462 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 455 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 490 aa  146  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  22.8 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  22.8 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  23.63 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 455 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  23.63 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 455 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  24.37 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  25.56 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 455 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 459 aa  140  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  24.52 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  26.43 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  27.82 
 
 		 457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1790  hypothetical protein  30 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  26.22 
 
 		 459 aa  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  24.78 
 
 		 496 aa  137  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  24.61 
 
 		 492 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  24.7 
 
 		 460 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  26.85 
 
 		 456 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 505 aa  134  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 486 aa  133  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  25.47 
 
 		 453 aa  133  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 453 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 480 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 467 aa  132  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  27.38 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  27.32 
 
 		 476 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 462 aa  131  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  27.36 
 
 		 468 aa  131  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  24.7 
 
 		 453 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  26.57 
 
 		 428 aa  130  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 456 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  23.76 
 
 		 467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 460 aa  126  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0308  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 441 aa  126  8.000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.426716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>