226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2695 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0263  hypothetical protein  41.3 
 
 		 905 aa  682    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0236828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2695  hypothetical protein  100 
 
 		 854 aa  1756    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3079  hypothetical protein  40.34 
 
 		 930 aa  637    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0337116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3734  hypothetical protein  27.17 
 
 		 849 aa  283  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  27.4 
 
 		 816 aa  282  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  25.76 
 
 		 828 aa  265  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1102  hypothetical protein  23.81 
 
 		 925 aa  178  4e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.778272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  26.59 
 
 		 829 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  39.36 
 
 		 1039 aa  65.1  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  33.91 
 
 		 814 aa  64.7  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 1038 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3440  hypothetical protein  26.71 
 
 		 853 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  22.65 
 
 		 828 aa  62.4  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2647  hypothetical protein  24.31 
 
 		 839 aa  62  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  31.13 
 
 		 805 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1525  hypothetical protein  23.62 
 
 		 855 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0931717  normal  0.114595 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 922 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 791 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  22.81 
 
 		 856 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1142 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 1103 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1070 aa  58.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 924 aa  57.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1716  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 1051 aa  57.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.854404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  34.18 
 
 		 1087 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  34.12 
 
 		 1148 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2875  hypothetical protein  28.23 
 
 		 843 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  31.25 
 
 		 827 aa  56.2  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  35.16 
 
 		 1165 aa  56.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 		 1081 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1071 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 785 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 792 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 778 aa  55.5  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 787 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 814 aa  55.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  34.12 
 
 		 1012 aa  55.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 1076 aa  54.7  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1641  hypothetical protein  21.17 
 
 		 853 aa  54.7  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819235  normal  0.0314988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  24.24 
 
 		 1127 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  24.68 
 
 		 1065 aa  54.3  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1124 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1072 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 1148 aa  54.3  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 833 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 1056 aa  53.5  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 1076 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 775 aa  53.5  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 824 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.93 
 
 		 957 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1064 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 1096 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 1068 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 814 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  30.19 
 
 		 794 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1058 aa  52.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 		 1168 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1079 aa  51.6  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1021 aa  52  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  32.94 
 
 		 1034 aa  51.6  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  28.89 
 
 		 1025 aa  51.6  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  25.22 
 
 		 817 aa  51.6  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 1127 aa  51.6  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  26.96 
 
 		 1100 aa  51.6  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1098 aa  51.2  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1008 aa  51.2  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 1026 aa  51.2  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  23.02 
 
 		 1041 aa  51.2  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 887 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  24.16 
 
 		 1102 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 994 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 852 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  21.7 
 
 		 791 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1040 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  36.05 
 
 		 848 aa  50.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 1001 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  23.78 
 
 		 1186 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  22.86 
 
 		 988 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  23.58 
 
 		 1064 aa  49.7  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  30.19 
 
 		 1030 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 		 795 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1181 aa  50.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1096 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 1020 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1040 aa  50.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 1189 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  22.86 
 
 		 1122 aa  50.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 769 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  25.95 
 
 		 803 aa  50.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1161 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 		 1217 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 907 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 1040 aa  49.7  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  23.58 
 
 		 812 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1097  TonB-dependent receptor plug  36.51 
 
 		 1148 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00128264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 1062 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1075 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1036 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  24.14 
 
 		 1107 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  23.84 
 
 		 1095 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>